59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2503 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  49.05 
 
 		 742 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  44.97 
 
 		 1193 aa  663    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  51.5 
 
 		 991 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  42.91 
 
 		 1479 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  100 
 
 		 803 aa  1662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  42.68 
 
 		 790 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  37.65 
 
 		 825 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  38.65 
 
 		 816 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  37.84 
 
 		 868 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  39.6 
 
 		 825 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  37.67 
 
 		 842 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  37.79 
 
 		 833 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  38.76 
 
 		 759 aa  492  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  38.83 
 
 		 768 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  36.96 
 
 		 864 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.93 
 
 		 1094 aa  475  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  41.65 
 
 		 940 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  36.12 
 
 		 822 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.43 
 
 		 784 aa  469  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  35.72 
 
 		 781 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  36.86 
 
 		 841 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  38.01 
 
 		 741 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1139 aa  453  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  37.22 
 
 		 758 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  36.27 
 
 		 778 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  36.62 
 
 		 811 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  36.62 
 
 		 802 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  38.01 
 
 		 1164 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  36.54 
 
 		 796 aa  444  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  34.44 
 
 		 786 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  37.65 
 
 		 747 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  36.13 
 
 		 757 aa  429  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  34.71 
 
 		 835 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  33.12 
 
 		 760 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  35.12 
 
 		 773 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  34.05 
 
 		 809 aa  364  4e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  31.43 
 
 		 809 aa  354  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  32.53 
 
 		 824 aa  347  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  31.96 
 
 		 856 aa  331  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  31.92 
 
 		 943 aa  318  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  31.59 
 
 		 831 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  40.17 
 
 		 646 aa  304  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  32.17 
 
 		 781 aa  298  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  37.42 
 
 		 837 aa  294  5e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  29.12 
 
 		 804 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  30.95 
 
 		 762 aa  283  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  28.93 
 
 		 788 aa  265  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  33.75 
 
 		 808 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  26.99 
 
 		 819 aa  214  7e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  26.27 
 
 		 753 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  25.33 
 
 		 809 aa  180  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  29.92 
 
 		 770 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  29.51 
 
 		 757 aa  151  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  46.55 
 
 		 116 aa  98.2  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  34.36 
 
 		 262 aa  89  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  23.62 
 
 		 750 aa  84  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  24.75 
 
 		 928 aa  64.7  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  22.63 
 
 		 765 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  23.29 
 
 		 948 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>