59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2698 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  48 
 
 		 833 aa  741    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  42.87 
 
 		 825 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  46.16 
 
 		 786 aa  690    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  46.19 
 
 		 802 aa  690    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  41.14 
 
 		 864 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  45.99 
 
 		 822 aa  724    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  42.09 
 
 		 816 aa  658    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  47.43 
 
 		 825 aa  741    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 868 aa  1795    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  46 
 
 		 841 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  41.87 
 
 		 842 aa  656    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.42 
 
 		 1094 aa  630  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  40.98 
 
 		 811 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  42.14 
 
 		 768 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.12 
 
 		 784 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  41.97 
 
 		 759 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  39.92 
 
 		 1193 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  42.96 
 
 		 940 aa  550  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  40.08 
 
 		 741 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  39.58 
 
 		 747 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  38.97 
 
 		 781 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  39.17 
 
 		 1479 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  37.58 
 
 		 778 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  36.69 
 
 		 1139 aa  518  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  38.58 
 
 		 991 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  39.07 
 
 		 1164 aa  511  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  39.19 
 
 		 790 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  38.38 
 
 		 824 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  37.84 
 
 		 803 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  37.89 
 
 		 835 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  37.53 
 
 		 742 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  37.97 
 
 		 758 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  34.24 
 
 		 757 aa  468  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  38.01 
 
 		 856 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  36.34 
 
 		 809 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  35.44 
 
 		 760 aa  436  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  33.65 
 
 		 837 aa  429  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  32.81 
 
 		 796 aa  395  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  34.14 
 
 		 831 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.31 
 
 		 781 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  39.13 
 
 		 646 aa  333  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  30.1 
 
 		 762 aa  323  8e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  31.23 
 
 		 819 aa  312  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  28.98 
 
 		 788 aa  305  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  28.86 
 
 		 773 aa  288  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  29.33 
 
 		 943 aa  287  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  39.62 
 
 		 808 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  29.43 
 
 		 809 aa  258  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  27.99 
 
 		 804 aa  253  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  25.26 
 
 		 809 aa  187  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  23.35 
 
 		 770 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  24.97 
 
 		 753 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  24.09 
 
 		 757 aa  144  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  39.31 
 
 		 262 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  45.87 
 
 		 116 aa  97.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  21.93 
 
 		 928 aa  80.9  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  24.15 
 
 		 750 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4428  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 		 668 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.963425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2641  glycoside hydrolase family protein  38.33 
 
 		 395 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>