56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5561 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 757 aa  1481    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  61.84 
 
 		 753 aa  850    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  37.17 
 
 		 809 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  28.53 
 
 		 757 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  29.37 
 
 		 741 aa  190  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.86 
 
 		 784 aa  187  7e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  26.73 
 
 		 825 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.25 
 
 		 1094 aa  181  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  26.81 
 
 		 825 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  27.25 
 
 		 842 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  26.24 
 
 		 928 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  24.51 
 
 		 868 aa  174  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  25 
 
 		 822 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  24.97 
 
 		 811 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  28.84 
 
 		 824 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  25.03 
 
 		 768 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  26.47 
 
 		 841 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  24.49 
 
 		 833 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  25.38 
 
 		 759 aa  163  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  35.76 
 
 		 837 aa  160  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  30.12 
 
 		 803 aa  160  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  24.97 
 
 		 758 aa  158  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  23.4 
 
 		 816 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  25.73 
 
 		 864 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 		 778 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  24.97 
 
 		 1193 aa  154  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  34.02 
 
 		 646 aa  153  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 781 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  24.75 
 
 		 802 aa  151  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  30.75 
 
 		 809 aa  150  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1139 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  31.55 
 
 		 781 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  24.45 
 
 		 1164 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  24.49 
 
 		 786 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  28.06 
 
 		 790 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  30.77 
 
 		 991 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  24.8 
 
 		 760 aa  137  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  25.54 
 
 		 940 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  27.14 
 
 		 796 aa  131  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  27.5 
 
 		 747 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  26.73 
 
 		 1479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  27.43 
 
 		 742 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 		 835 aa  124  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  30.28 
 
 		 773 aa  121  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  27.07 
 
 		 856 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  26.76 
 
 		 804 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  23.89 
 
 		 788 aa  116  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  32.04 
 
 		 808 aa  115  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  27.88 
 
 		 762 aa  114  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  28.87 
 
 		 819 aa  113  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  25.85 
 
 		 831 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  26.73 
 
 		 943 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  26.27 
 
 		 809 aa  95.5  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  22.99 
 
 		 770 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  19.91 
 
 		 750 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4099  hypothetical protein  24.63 
 
 		 794 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.457724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>