60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6800 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 778 aa  1612    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  44.14 
 
 		 1139 aa  677    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  64.15 
 
 		 781 aa  1065    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  44.6 
 
 		 835 aa  612  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  40.89 
 
 		 825 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  41.47 
 
 		 825 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  40 
 
 		 816 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.47 
 
 		 1094 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  39.25 
 
 		 822 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  39.92 
 
 		 842 aa  542  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  38.59 
 
 		 790 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  37.58 
 
 		 868 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  37.41 
 
 		 833 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  38.12 
 
 		 802 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  38.08 
 
 		 841 aa  519  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  38.5 
 
 		 1193 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  37.55 
 
 		 768 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  37.84 
 
 		 811 aa  512  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  36.42 
 
 		 864 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  38.37 
 
 		 1479 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  38.82 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  37.04 
 
 		 786 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  36.83 
 
 		 741 aa  492  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.09 
 
 		 784 aa  484  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  37.03 
 
 		 991 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  39.43 
 
 		 940 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  35.33 
 
 		 747 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  36.59 
 
 		 758 aa  459  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  36.27 
 
 		 803 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  37.6 
 
 		 742 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  34.26 
 
 		 1164 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  34.8 
 
 		 760 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  33.56 
 
 		 757 aa  416  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  34.22 
 
 		 796 aa  391  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  32.19 
 
 		 856 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  31.19 
 
 		 809 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  33.2 
 
 		 831 aa  366  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  30.7 
 
 		 788 aa  345  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  31.84 
 
 		 824 aa  343  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  37.92 
 
 		 837 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  32.36 
 
 		 781 aa  327  7e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  30.46 
 
 		 804 aa  324  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  35.47 
 
 		 646 aa  315  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  29.87 
 
 		 943 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  30.25 
 
 		 762 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  28.7 
 
 		 773 aa  275  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 		 808 aa  270  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  27.83 
 
 		 809 aa  250  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  32.84 
 
 		 819 aa  222  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  26.22 
 
 		 809 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  24.01 
 
 		 770 aa  160  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  26.96 
 
 		 757 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  24.51 
 
 		 753 aa  110  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  34.39 
 
 		 262 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  23.99 
 
 		 750 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  40.57 
 
 		 116 aa  80.9  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  21.96 
 
 		 928 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  21.89 
 
 		 765 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  22.76 
 
 		 948 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2146  hypothetical protein  26.44 
 
 		 784 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292237  normal  0.414458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>