62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1856 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  46.45 
 
 		 835 aa  650    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  64.15 
 
 		 778 aa  1065    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 781 aa  1612    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  45.96 
 
 		 1139 aa  695    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  42.35 
 
 		 825 aa  612  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  40.44 
 
 		 825 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  41.15 
 
 		 842 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.18 
 
 		 1094 aa  575  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  40.08 
 
 		 816 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  39.68 
 
 		 822 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  40.44 
 
 		 768 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  38.87 
 
 		 833 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  40.35 
 
 		 759 aa  542  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  38.72 
 
 		 786 aa  539  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  39.01 
 
 		 802 aa  539  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  39.51 
 
 		 841 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  38.97 
 
 		 868 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  38.97 
 
 		 811 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  36.9 
 
 		 790 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  38.65 
 
 		 741 aa  532  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  36.26 
 
 		 864 aa  515  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  39.47 
 
 		 1479 aa  515  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  38.85 
 
 		 1193 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.72 
 
 		 784 aa  505  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  41.05 
 
 		 940 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  37.01 
 
 		 758 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  35.79 
 
 		 747 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  35.72 
 
 		 803 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  35.37 
 
 		 757 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  37.53 
 
 		 1164 aa  452  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  36.1 
 
 		 991 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  35.95 
 
 		 760 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  36.22 
 
 		 742 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  34.42 
 
 		 824 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  34.79 
 
 		 796 aa  397  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  32.14 
 
 		 809 aa  376  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  31.61 
 
 		 856 aa  362  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  32.12 
 
 		 831 aa  356  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  31.55 
 
 		 788 aa  343  5e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  32.07 
 
 		 781 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  30.5 
 
 		 804 aa  333  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  38.77 
 
 		 837 aa  333  6e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  30.9 
 
 		 943 aa  332  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  35.23 
 
 		 646 aa  323  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  30.88 
 
 		 762 aa  306  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  30.1 
 
 		 808 aa  276  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  28.27 
 
 		 773 aa  272  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  25.89 
 
 		 819 aa  246  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  28.52 
 
 		 809 aa  245  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  26.21 
 
 		 809 aa  207  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  26.43 
 
 		 770 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  28.03 
 
 		 757 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  36.08 
 
 		 262 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  24.14 
 
 		 753 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  23.18 
 
 		 750 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  43.01 
 
 		 116 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  20.62 
 
 		 928 aa  71.2  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  23.26 
 
 		 765 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  23.67 
 
 		 1148 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2146  hypothetical protein  25.68 
 
 		 784 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292237  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1176 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2175  hypothetical protein  32.67 
 
 		 774 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>