57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0874 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  47.19 
 
 		 759 aa  669    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 760 aa  1588    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  40.78 
 
 		 758 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.26 
 
 		 784 aa  543  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  39.63 
 
 		 757 aa  537  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  36.77 
 
 		 816 aa  510  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  38.08 
 
 		 842 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.25 
 
 		 1094 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  37.06 
 
 		 811 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  36.3 
 
 		 741 aa  480  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  37.35 
 
 		 768 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  35.85 
 
 		 841 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  35.95 
 
 		 781 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  34.38 
 
 		 833 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  35.1 
 
 		 825 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  34.71 
 
 		 802 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 864 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  34.45 
 
 		 825 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  35.14 
 
 		 747 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  35.44 
 
 		 868 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  33.38 
 
 		 822 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  36.77 
 
 		 831 aa  437  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  36.34 
 
 		 1193 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  34.8 
 
 		 778 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  34.63 
 
 		 786 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  33.67 
 
 		 790 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  36.19 
 
 		 940 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  36.29 
 
 		 835 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1139 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  33.12 
 
 		 803 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  34.24 
 
 		 1479 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  33.2 
 
 		 991 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  33.64 
 
 		 742 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  32.14 
 
 		 1164 aa  365  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  32.1 
 
 		 856 aa  364  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  30.69 
 
 		 824 aa  354  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  31 
 
 		 809 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  29.34 
 
 		 796 aa  336  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  31.2 
 
 		 781 aa  323  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  27.92 
 
 		 788 aa  311  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  38.44 
 
 		 646 aa  294  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  36.77 
 
 		 837 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  29.05 
 
 		 762 aa  286  8e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  28.43 
 
 		 773 aa  284  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  27.83 
 
 		 819 aa  254  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  29 
 
 		 804 aa  250  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  28.03 
 
 		 943 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  27.05 
 
 		 808 aa  248  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  26.74 
 
 		 809 aa  204  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  27.21 
 
 		 809 aa  204  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  25.34 
 
 		 753 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  25.56 
 
 		 770 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  28.51 
 
 		 757 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  34.73 
 
 		 262 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  21.59 
 
 		 750 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  21.93 
 
 		 928 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  40.37 
 
 		 116 aa  82.4  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>