58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1192 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  100 
 
 
837 aa  1603    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  48.37 
 
 
781 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  35.87 
 
 
825 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  35.24 
 
 
822 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  42.79 
 
 
856 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  35.37 
 
 
833 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  33.75 
 
 
802 aa  465  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  33.96 
 
 
868 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  35.68 
 
 
825 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  44.62 
 
 
808 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  32.92 
 
 
786 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  42.81 
 
 
809 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  39.97 
 
 
824 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.78 
 
 
1094 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  34.2 
 
 
841 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  34.19 
 
 
768 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  35.01 
 
 
811 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  35.53 
 
 
842 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  32.11 
 
 
864 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  34.45 
 
 
759 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  53.16 
 
 
646 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  32.49 
 
 
816 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  36.17 
 
 
1139 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  36.71 
 
 
940 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  35.7 
 
 
741 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  35.89 
 
 
819 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.28 
 
 
784 aa  379  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  35.07 
 
 
757 aa  376  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  35.54 
 
 
747 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  32.27 
 
 
790 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  30.99 
 
 
778 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  39.55 
 
 
762 aa  368  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 
781 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  31.73 
 
 
758 aa  365  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  31.81 
 
 
835 aa  353  5.9999999999999994e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  29.09 
 
 
1164 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  29.01 
 
 
1193 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  30.61 
 
 
803 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  32.89 
 
 
742 aa  313  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  30.07 
 
 
760 aa  307  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  37.04 
 
 
1479 aa  287  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  33.08 
 
 
796 aa  269  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  37.98 
 
 
991 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  30.49 
 
 
831 aa  253  9.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  37.94 
 
 
773 aa  251  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  34.45 
 
 
788 aa  248  3e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.771982 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  29.47 
 
 
809 aa  207  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  31.87 
 
 
943 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  30.57 
 
 
804 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  32.94 
 
 
809 aa  161  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  35.1 
 
 
757 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  29.09 
 
 
753 aa  149  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  25.92 
 
 
770 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  22.22 
 
 
750 aa  95.9  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  40.5 
 
 
116 aa  79.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  25.36 
 
 
928 aa  67.8  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  31.44 
 
 
262 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2641  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 
395 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>