90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2817 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  52.57 
 
 		 768 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 940 aa  1932    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  47.55 
 
 		 825 aa  606  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  44.89 
 
 		 842 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  45.27 
 
 		 816 aa  589  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.45 
 
 		 1094 aa  577  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  43.13 
 
 		 747 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  42.96 
 
 		 868 aa  550  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  43.31 
 
 		 811 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  43.37 
 
 		 1164 aa  529  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  40.03 
 
 		 864 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  42.2 
 
 		 825 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  40.64 
 
 		 741 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  41.1 
 
 		 841 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  42.75 
 
 		 802 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  44.81 
 
 		 759 aa  509  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  43.03 
 
 		 822 aa  509  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  41.05 
 
 		 781 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  40.74 
 
 		 833 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  42.13 
 
 		 1193 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  41.29 
 
 		 786 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  41.8 
 
 		 790 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.38 
 
 		 784 aa  488  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  39.79 
 
 		 1479 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  39.43 
 
 		 778 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  37.4 
 
 		 1139 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  41.65 
 
 		 803 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  40.33 
 
 		 835 aa  445  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  38.96 
 
 		 742 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  37.42 
 
 		 991 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  36.11 
 
 		 757 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  36.3 
 
 		 760 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  36.02 
 
 		 758 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  35.76 
 
 		 796 aa  382  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  36.53 
 
 		 824 aa  379  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  43.23 
 
 		 837 aa  358  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  34.15 
 
 		 856 aa  355  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  33.48 
 
 		 809 aa  337  5e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  33.98 
 
 		 831 aa  333  9e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 781 aa  323  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  40.43 
 
 		 646 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  31.7 
 
 		 773 aa  277  7e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  37.08 
 
 		 762 aa  271  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  30.76 
 
 		 943 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  32.18 
 
 		 804 aa  267  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  30.21 
 
 		 809 aa  253  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 808 aa  252  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  28.37 
 
 		 788 aa  235  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  31.34 
 
 		 819 aa  229  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  25.9 
 
 		 809 aa  162  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  24.85 
 
 		 753 aa  147  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  25.49 
 
 		 770 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  28.5 
 
 		 757 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  22.73 
 
 		 750 aa  110  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  48.89 
 
 		 262 aa  97.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1337  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.93 
 
 		 650 aa  95.9  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0760  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  40.52 
 
 		 657 aa  94.7  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  52.33 
 
 		 116 aa  94  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1080  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.59 
 
 		 652 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.102496 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1262  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  37.18 
 
 		 635 aa  90.5  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2722  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.97 
 
 		 628 aa  89  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4847  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.71 
 
 		 637 aa  87.8  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277703  hitchhiker  0.00343122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1717  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.81 
 
 		 642 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1628  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.11 
 
 		 678 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0773  protein of unknown function DUF303, acetylesterase putative  36.23 
 
 		 648 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2658  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.12 
 
 		 639 aa  74.7  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03853  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  32.12 
 
 		 646 aa  72.4  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1891  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3210  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30 
 
 		 666 aa  64.7  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.238691  normal  0.254476 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2492  ExsB  31.06 
 
 		 661 aa  60.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1304  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.68 
 
 		 643 aa  60.1  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2403  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.59 
 
 		 644 aa  57  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22974  normal  0.390685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  25.12 
 
 		 928 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  28.68 
 
 		 1046 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.33 
 
 		 1781 aa  49.3  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  28.46 
 
 		 1084 aa  48.9  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 1084 aa  48.9  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 		 1049 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  28.57 
 
 		 1059 aa  48.5  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  31.19 
 
 		 677 aa  48.1  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 571 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  32.11 
 
 		 1355 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 		 1079 aa  47  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 873 aa  45.8  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.33 
 
 		 913 aa  45.8  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1852  glycoside hydrolase family protein  24.31 
 
 		 638 aa  45.8  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.37 
 
 		 805 aa  45.8  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.77 
 
 		 984 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  22 
 
 		 1094 aa  45.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  27.69 
 
 		 1035 aa  45.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>