More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0951 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 571 aa  1180    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1891  glycoside hydrolase family protein  35.92 
 
 		 362 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  35.66 
 
 		 300 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 301 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 301 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  33.61 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 		 1201 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 302 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5369  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  38 
 
 		 113 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  32.67 
 
 		 287 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  37.62 
 
 		 113 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  33.59 
 
 		 250 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  32.67 
 
 		 301 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 308 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  38 
 
 		 113 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1997  DNA-binding transcriptional activator MarA  31.53 
 
 		 127 aa  70.1  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  32.69 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  32.69 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  36.56 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6523  transcriptional regulator, AraC family  26.76 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.399934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  31.37 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2642  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 109 aa  68.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.736887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 319 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 319 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 319 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 315 aa  67  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  37 
 
 		 113 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 309 aa  66.6  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 322 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6111  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  37 
 
 		 113 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  35.85 
 
 		 250 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1816  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.97 
 
 		 127 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1691  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.97 
 
 		 127 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1632  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.97 
 
 		 127 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 319 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1624  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.97 
 
 		 127 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.936948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 760 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1651  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.97 
 
 		 127 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00571718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 113 aa  66.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01490  DNA-binding transcriptional dual activator of multiple antibiotic resistance  30.97 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2115  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000178307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1066  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1733  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.97 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2127  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.97 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.299134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1639  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.97 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1674  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.97 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01501  hypothetical protein  30.97 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2145  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.97 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  28.47 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>