48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1891 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1891  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 362 aa  735    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0773  protein of unknown function DUF303, acetylesterase putative  32.18 
 
 		 648 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 571 aa  89.7  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4847  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.55 
 
 		 637 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277703  hitchhiker  0.00343122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1717  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.3 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1628  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.55 
 
 		 678 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1080  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.19 
 
 		 652 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.102496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2492  ExsB  28.85 
 
 		 661 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1262  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  28 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1337  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.93 
 
 		 650 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0760  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.03 
 
 		 657 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1304  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.94 
 
 		 643 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  31.61 
 
 		 940 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2722  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  24.41 
 
 		 628 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2658  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.81 
 
 		 639 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3210  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  29.66 
 
 		 666 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.238691  normal  0.254476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03853  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  36.09 
 
 		 646 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1852  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 		 638 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  31.08 
 
 		 1392 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.78 
 
 		 686 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  30.37 
 
 		 704 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 		 888 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  28.39 
 
 		 1108 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  27.91 
 
 		 859 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 806 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.82 
 
 		 805 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  28.17 
 
 		 626 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  27.91 
 
 		 1076 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  26.95 
 
 		 1171 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.13 
 
 		 1018 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  30.81 
 
 		 677 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.47 
 
 		 892 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2403  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  28.64 
 
 		 644 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22974  normal  0.390685 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  34.35 
 
 		 889 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 		 1077 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  28.39 
 
 		 1003 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  27.56 
 
 		 1063 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  35.34 
 
 		 864 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  28.91 
 
 		 807 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.33 
 
 		 923 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.38 
 
 		 1003 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  28.79 
 
 		 1355 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.79 
 
 		 707 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 		 1175 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  39.13 
 
 		 625 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 1045 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  26.67 
 
 		 410 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>