More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1066 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1066  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1069  transcriptional regulator, AraC family  88.34 
 
 
299 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 
278 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  44.76 
 
 
265 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  38.42 
 
 
284 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 
336 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 
288 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  46.43 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  26.92 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  22.83 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0827  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000316121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  23.01 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.13 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  23.15 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  28.81 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  23.05 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0972  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  33.33 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  31.85 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29.07 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.01 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 
506 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2175  AraC family transcriptional regulator  44.71 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.54 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0129  transcriptional regulator, AraC family  22.67 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  24.59 
 
 
535 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.31 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  25.31 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.31 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.31 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.31 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.61 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.31 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.31 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.31 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  25.31 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  23.63 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3787  transcriptional regulator, AraC family  21.86 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0471905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.61 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.61 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.61 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.61 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 
556 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
251 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  19.68 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  20.59 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
1201 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 
571 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  23.9 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 
409 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3015  transcriptional regulator  38 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103584  normal  0.15969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 
773 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  21.24 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  31 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  21.91 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>