More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4740 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  45.08 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  44 
 
 		 289 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  44.21 
 
 		 326 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1069  transcriptional regulator, AraC family  37.17 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 515 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1066  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 1201 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 136 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 546 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 535 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 513 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  34.95 
 
 		 529 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2690  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0591  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 533 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 519 aa  68.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3619  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.425647 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.94 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00620911 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2115  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  38.55 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3056  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.351096  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 550 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 485 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  27.03 
 
 		 1561 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 		 940 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  33.33 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  33.33 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.94 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  30.48 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  30.48 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4063  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.453209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  30.48 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3876  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3892  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  30.48 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 719 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4001  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.940351  normal  0.48087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  30.48 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03950  hypothetical protein  32.29 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03989  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.29 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3874  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5632  DNA-binding transcriptional regulator MelR  32.29 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4407  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4584  DNA-binding transcriptional regulator MelR  32.29 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 600 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4359  DNA-binding transcriptional regulator MelR  32.29 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4615  DNA-binding transcriptional regulator MelR  32.29 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0074  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  30.53 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3909  DNA-binding transcriptional regulator MelR  32.29 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2883  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000839866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3956  putative regulatory protein  32.29 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0244269  normal  0.828136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4672  DNA-binding transcriptional regulator MelR  32.29 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  22.98 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>