More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3909 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03989  DNA-binding transcriptional dual regulator  100 
 
 		 302 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3874  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 302 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03950  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  637    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3909  DNA-binding transcriptional regulator MelR  100 
 
 		 302 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4584  DNA-binding transcriptional regulator MelR  99.67 
 
 		 302 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4615  DNA-binding transcriptional regulator MelR  99.67 
 
 		 302 aa  636    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4359  DNA-binding transcriptional regulator MelR  100 
 
 		 302 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5632  DNA-binding transcriptional regulator MelR  99.67 
 
 		 302 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4672  DNA-binding transcriptional regulator MelR  100 
 
 		 302 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4643  DNA-binding transcriptional regulator MelR  88.85 
 
 		 296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4561  DNA-binding transcriptional regulator MelR  88.85 
 
 		 296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4643  DNA-binding transcriptional regulator MelR  88.85 
 
 		 296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4552  DNA-binding transcriptional regulator MelR  88.85 
 
 		 296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4692  DNA-binding transcriptional regulator MelR  88.85 
 
 		 296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.887715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2344  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 291 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  decreased coverage  0.000000160682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1626  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2295  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 291 aa  179  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6523  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.399934 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5369  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239018 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6111  transcriptional regulator, AraC family  29.12 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5735  transcriptional regulator AraC family  26.79 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5309  helix-turn-helix domain-containing protein  28.36 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.446177 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4754  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05000  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  26.76 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.989106  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3465  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.48 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0879036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 1201 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  23.55 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2239  AraC family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 118 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 760 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  36.56 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 519 aa  68.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1972  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 701 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000433091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2690  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 515 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 204 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  26.61 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 513 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  26.61 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2452  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 701 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0494728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1706  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 778 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0404668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2405  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 701 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.269245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4482  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1831  transcriptional regulator ArgR  30.28 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4287  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  32.35 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3771  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128178  normal  0.013148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  29.7 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3987  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1433  helix-turn-helix domain-containing protein  30.28 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.392956  normal  0.582162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3566  helix-turn-helix, AraC type  30.28 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34510  ArgR-like transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 539 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2912  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  21.43 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4621  transcriptional regulator ArgR  30.48 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1802  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0740  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52740  transcriptional regulator ArgR  30.48 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>