More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0936 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 289 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3619  transcriptional regulator, AraC family  43.77 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.425647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3298  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000257264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1984  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.91 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  22.61 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.12 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.12 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.12 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  32.12 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.12 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.12 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.12 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.12 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 538 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.32 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.32 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.32 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.32 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.31 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.32 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38.46 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  42 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.26 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.26 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.26 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.26 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.61 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.19 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  41.49 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0326  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  24.85 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.7 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  36.91 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  31.48 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.56 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2354  transcriptional regulator, AraC family  43.53 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  29 
 
 		 529 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  20.97 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  29.79 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 548 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  35.92 
 
 		 306 aa  72  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  30.32 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  20.74 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 513 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 223 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  42.35 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  35.29 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.29 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  28.72 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.3 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6996  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  26.04 
 
 		 537 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>