More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4327 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  100 
 
 
278 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
278 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  100 
 
 
278 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  99.64 
 
 
283 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
283 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  89.57 
 
 
283 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  89.57 
 
 
283 aa  501  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  89.21 
 
 
283 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  89.21 
 
 
283 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  89.21 
 
 
283 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  89.21 
 
 
283 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  89.21 
 
 
283 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  89.21 
 
 
283 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0868  AraC family transcriptional regulator  55.36 
 
 
291 aa  326  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3661  AraC family transcriptional regulator  55.36 
 
 
291 aa  326  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3531  AraC family transcriptional regulator  55.36 
 
 
291 aa  326  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1419  transcriptional regulator  36.46 
 
 
279 aa  179  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05185  hypothetical protein  37.19 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001306  putative ARAC-type regulatory protein  36.49 
 
 
280 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0893  putative HTH-type regulatory protein, AraC family  34.91 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.364356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3614  transcriptional regulator, AraC family  36.2 
 
 
285 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.950607 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1275  transcriptional regulator, AraC family  36.2 
 
 
285 aa  161  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2519  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 
285 aa  161  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1287  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 
285 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02292  predicted DNA-binding protein  35.84 
 
 
285 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02253  hypothetical protein  35.84 
 
 
285 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2672  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 
285 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2751  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 
285 aa  158  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2534  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
285 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  35.66 
 
 
502 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 
513 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 
440 aa  86.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 
492 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 
534 aa  86.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 
544 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  26.26 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  38.58 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 
515 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  42.42 
 
 
519 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
546 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.13 
 
 
530 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  35.2 
 
 
539 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1509  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 
1201 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  39.39 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 
525 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 
509 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  39.39 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  39.39 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  39.39 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  39.39 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  39.39 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 
538 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
548 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0209  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 
519 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 
146 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 
525 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 
544 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  29.01 
 
 
507 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3979  two component transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 
427 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  30.7 
 
 
537 aa  70.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0591  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 
526 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  33.94 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 
412 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
348 aa  68.9  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 
533 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  28.24 
 
 
507 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  33 
 
 
517 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4262  transcriptional activator RhaS  33.03 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3084  response regulator receiver protein  35.51 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 
494 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
529 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0385  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 
766 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3204  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  30.25 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 
532 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>