57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4847 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1717  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  55.94 
 
 
642 aa  743    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4847  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  100 
 
 
637 aa  1312    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277703  hitchhiker  0.00343122 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2722  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  46.63 
 
 
628 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1262  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  46.79 
 
 
635 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2492  ExsB  41 
 
 
661 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795062  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0773  protein of unknown function DUF303, acetylesterase putative  36.14 
 
 
648 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2658  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.12 
 
 
639 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1080  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.41 
 
 
652 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0760  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.88 
 
 
657 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3210  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.78 
 
 
666 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.238691  normal  0.254476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1337  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.23 
 
 
650 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.377113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0312  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.57 
 
 
651 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1628  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.44 
 
 
678 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03853  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  36.84 
 
 
646 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1304  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.38 
 
 
643 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1852  glycoside hydrolase family protein  33.44 
 
 
638 aa  333  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0830  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  32.51 
 
 
635 aa  333  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174832  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2403  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.07 
 
 
644 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22974  normal  0.390685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1583  Sialate O-acetylesterase  47.66 
 
 
486 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2308  Sialate O-acetylesterase  47.56 
 
 
485 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0493483  normal  0.0486677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2636  Sialate O-acetylesterase  44.54 
 
 
499 aa  206  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1155  sialate O-acetylesterase  41.74 
 
 
492 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1697  sialate O-acetylesterase  41.25 
 
 
503 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240139  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4232  sialate O-acetylesterase  37.87 
 
 
511 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2743  Sialate O-acetylesterase  37.45 
 
 
482 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.917313  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4964  sialate O-acetylesterase  38.57 
 
 
459 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2783  Sialate O-acetylesterase  37.18 
 
 
477 aa  158  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000307514  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4100  sialate O-acetylesterase  38.14 
 
 
474 aa  157  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4857  Sialate O-acetylesterase  37.34 
 
 
469 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000781027  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2210  Sialate O-acetylesterase  36.33 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.32552  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1034  Sialate O-acetylesterase  37.23 
 
 
689 aa  149  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3252  Sialate O-acetylesterase  32.52 
 
 
689 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1291  Sialate O-acetylesterase  36.44 
 
 
463 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1315  Sialate O-acetylesterase  34.35 
 
 
469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3021  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.96 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000125756  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2622  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.29 
 
 
521 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259122  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3770  Sialate O-acetylesterase  36.22 
 
 
468 aa  123  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0438855  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0454  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.39 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1436  hypothetical protein  33.77 
 
 
230 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000109275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  37.58 
 
 
940 aa  87.4  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1891  glycoside hydrolase family protein  36.55 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.69 
 
 
805 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  33.06 
 
 
625 aa  50.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  24.03 
 
 
707 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3540  hypothetical protein  20.76 
 
 
478 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 
571 aa  48.5  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.24 
 
 
704 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3865  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.25 
 
 
918 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.160045  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.13 
 
 
614 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  31.94 
 
 
309 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.94 
 
 
1289 aa  45.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.77 
 
 
986 aa  45.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  28.97 
 
 
600 aa  44.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  26.67 
 
 
889 aa  43.9  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.87 
 
 
813 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  28.45 
 
 
1144 aa  43.9  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 
807 aa  43.9  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>