289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6171 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  43.59 
 
 		 873 aa  654    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 813 aa  1707    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  55.1 
 
 		 824 aa  936    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.17 
 
 		 986 aa  660    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  42.27 
 
 		 919 aa  620  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  40.46 
 
 		 1015 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  41.84 
 
 		 928 aa  589  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  39.78 
 
 		 922 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  38.42 
 
 		 806 aa  575  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.98 
 
 		 805 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  40.62 
 
 		 903 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  40.57 
 
 		 891 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  38.44 
 
 		 827 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  36.08 
 
 		 1355 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.91 
 
 		 1781 aa  478  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.85 
 
 		 794 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 		 832 aa  465  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  34.07 
 
 		 1185 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.86 
 
 		 811 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  39.42 
 
 		 604 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.25 
 
 		 787 aa  412  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  32.54 
 
 		 961 aa  409  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  31.66 
 
 		 984 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  31.3 
 
 		 815 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.24 
 
 		 805 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 		 932 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 		 806 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 925 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  31.3 
 
 		 964 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 		 807 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  29.25 
 
 		 859 aa  360  5e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.53 
 
 		 1093 aa  360  5e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 858 aa  341  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.03 
 
 		 837 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  28.78 
 
 		 825 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 		 799 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.18 
 
 		 808 aa  301  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.36 
 
 		 882 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 829 aa  262  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 		 655 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.38 
 
 		 743 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.99 
 
 		 862 aa  204  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.7 
 
 		 750 aa  200  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  26.38 
 
 		 897 aa  194  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.75 
 
 		 858 aa  193  9e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 888 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 		 803 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25.75 
 
 		 1171 aa  187  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 1175 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  24.46 
 
 		 848 aa  181  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  27.03 
 
 		 704 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.15 
 
 		 707 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 979 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  23.4 
 
 		 766 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.95 
 
 		 824 aa  169  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  27.97 
 
 		 894 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  40.93 
 
 		 309 aa  160  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  23.27 
 
 		 717 aa  160  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 781 aa  154  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.3 
 
 		 781 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  23.64 
 
 		 763 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  27.16 
 
 		 1019 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.03 
 
 		 1036 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  24.43 
 
 		 785 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.29 
 
 		 607 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.55 
 
 		 1053 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.44 
 
 		 913 aa  134  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  26.55 
 
 		 1129 aa  134  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  34.06 
 
 		 233 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.49 
 
 		 1033 aa  130  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 754 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.27 
 
 		 747 aa  128  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 598 aa  127  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  26.06 
 
 		 1024 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  25.37 
 
 		 1017 aa  126  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.53 
 
 		 748 aa  125  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.37 
 
 		 920 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  27.27 
 
 		 590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 1079 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  25.45 
 
 		 1059 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  26.75 
 
 		 1455 aa  120  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  26 
 
 		 1044 aa  120  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.07 
 
 		 1033 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 		 1077 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.15 
 
 		 741 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  25.78 
 
 		 1041 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  27.07 
 
 		 670 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.41 
 
 		 987 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  25.28 
 
 		 1045 aa  119  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25 
 
 		 1035 aa  118  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.05 
 
 		 1289 aa  118  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.38 
 
 		 1041 aa  118  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  27.73 
 
 		 603 aa  118  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.61 
 
 		 920 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 		 1094 aa  117  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.64 
 
 		 1026 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  24.03 
 
 		 596 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 1043 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  27.14 
 
 		 1024 aa  115  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  25.06 
 
 		 951 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>