53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2492 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2492  ExsB  100 
 
 
661 aa  1368    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795062  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1262  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  42.12 
 
 
635 aa  522  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4847  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  41.12 
 
 
637 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277703  hitchhiker  0.00343122 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2722  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  39.97 
 
 
628 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1717  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  42.13 
 
 
642 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2658  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.52 
 
 
639 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0760  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.7 
 
 
657 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0773  protein of unknown function DUF303, acetylesterase putative  32.47 
 
 
648 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3210  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.44 
 
 
666 aa  340  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.238691  normal  0.254476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1080  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.26 
 
 
652 aa  336  9e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1852  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 
638 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03853  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  30.58 
 
 
646 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0312  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.97 
 
 
651 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1337  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.84 
 
 
650 aa  310  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.377113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1304  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.17 
 
 
643 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0830  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  31.41 
 
 
635 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1628  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.33 
 
 
678 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2403  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.17 
 
 
644 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22974  normal  0.390685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2308  Sialate O-acetylesterase  43.19 
 
 
485 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0493483  normal  0.0486677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2636  Sialate O-acetylesterase  42.02 
 
 
499 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1583  Sialate O-acetylesterase  39.57 
 
 
486 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4232  sialate O-acetylesterase  36.72 
 
 
511 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1697  sialate O-acetylesterase  35.89 
 
 
503 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240139  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1155  sialate O-acetylesterase  37.2 
 
 
492 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4964  sialate O-acetylesterase  35.65 
 
 
459 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4857  Sialate O-acetylesterase  35.62 
 
 
469 aa  147  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000781027  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2743  Sialate O-acetylesterase  32.73 
 
 
482 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.917313  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4100  sialate O-acetylesterase  34.87 
 
 
474 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2783  Sialate O-acetylesterase  36.55 
 
 
477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000307514  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2210  Sialate O-acetylesterase  34.48 
 
 
466 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.32552  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2622  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.76 
 
 
521 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259122  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1291  Sialate O-acetylesterase  31.82 
 
 
463 aa  124  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1034  Sialate O-acetylesterase  31.33 
 
 
689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3770  Sialate O-acetylesterase  32.52 
 
 
468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0438855  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3252  Sialate O-acetylesterase  30.62 
 
 
689 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3021  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.31 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000125756  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1315  Sialate O-acetylesterase  31.84 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1436  hypothetical protein  30.13 
 
 
230 aa  108  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000109275  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0454  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.83 
 
 
512 aa  103  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1891  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
571 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  31.06 
 
 
940 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 
1045 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  28.26 
 
 
1076 aa  52  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2589  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  24.72 
 
 
661 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541867  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.78 
 
 
805 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.42 
 
 
815 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6639  hypothetical protein  29.92 
 
 
821 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.85 
 
 
986 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3151  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.62 
 
 
1077 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  26.72 
 
 
677 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  26.17 
 
 
859 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 
806 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>