40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0830 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0830  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  100 
 
 
635 aa  1305    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1852  glycoside hydrolase family protein  37.95 
 
 
638 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1080  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.49 
 
 
652 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102496 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2722  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.3 
 
 
628 aa  369  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1717  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.04 
 
 
642 aa  353  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0773  protein of unknown function DUF303, acetylesterase putative  32.03 
 
 
648 aa  353  5.9999999999999994e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1262  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.49 
 
 
635 aa  350  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03853  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  33.59 
 
 
646 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0312  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.81 
 
 
651 aa  336  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4847  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.45 
 
 
637 aa  333  7.000000000000001e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277703  hitchhiker  0.00343122 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0760  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.08 
 
 
657 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1337  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.18 
 
 
650 aa  302  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.377113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2492  ExsB  32.09 
 
 
661 aa  299  9e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795062  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1628  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.16 
 
 
678 aa  292  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1304  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.45 
 
 
643 aa  280  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2658  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.17 
 
 
639 aa  280  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3210  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.7 
 
 
666 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.238691  normal  0.254476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2403  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.84 
 
 
644 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22974  normal  0.390685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1583  Sialate O-acetylesterase  46.67 
 
 
486 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1155  sialate O-acetylesterase  44.05 
 
 
492 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2308  Sialate O-acetylesterase  44.35 
 
 
485 aa  200  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0493483  normal  0.0486677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2636  Sialate O-acetylesterase  44.4 
 
 
499 aa  196  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2743  Sialate O-acetylesterase  39.41 
 
 
482 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.917313  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1697  sialate O-acetylesterase  35.11 
 
 
503 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240139  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4232  sialate O-acetylesterase  40.35 
 
 
511 aa  173  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2210  Sialate O-acetylesterase  38.98 
 
 
466 aa  171  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.32552  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4857  Sialate O-acetylesterase  36.64 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000781027  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2783  Sialate O-acetylesterase  39.26 
 
 
477 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000307514  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4100  sialate O-acetylesterase  35.86 
 
 
474 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3021  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  42.42 
 
 
501 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000125756  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1034  Sialate O-acetylesterase  37.96 
 
 
689 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2622  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.2 
 
 
521 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259122  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1315  Sialate O-acetylesterase  33.91 
 
 
469 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1291  Sialate O-acetylesterase  36.48 
 
 
463 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4964  sialate O-acetylesterase  34.62 
 
 
459 aa  143  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3770  Sialate O-acetylesterase  36.1 
 
 
468 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0438855  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1436  hypothetical protein  32.3 
 
 
230 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000109275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3252  Sialate O-acetylesterase  33.77 
 
 
689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656334 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0454  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.61 
 
 
512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3540  hypothetical protein  21.33 
 
 
478 aa  58.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>