42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1852 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1852  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 638 aa  1313    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0830  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  37.6 
 
 		 635 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0773  protein of unknown function DUF303, acetylesterase putative  34.26 
 
 		 648 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1628  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.01 
 
 		 678 aa  359  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2722  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.96 
 
 		 628 aa  359  7e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4847  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.59 
 
 		 637 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277703  hitchhiker  0.00343122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1717  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.1 
 
 		 642 aa  340  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1080  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.19 
 
 		 652 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.102496 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1262  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.33 
 
 		 635 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3210  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.22 
 
 		 666 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.238691  normal  0.254476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1337  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.35 
 
 		 650 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0312  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.07 
 
 		 651 aa  323  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2492  ExsB  30.65 
 
 		 661 aa  314  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0760  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.9 
 
 		 657 aa  310  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1304  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.51 
 
 		 643 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2658  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.14 
 
 		 639 aa  293  7e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03853  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  30.27 
 
 		 646 aa  293  8e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2403  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  28.55 
 
 		 644 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22974  normal  0.390685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2308  Sialate O-acetylesterase  44.9 
 
 		 485 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0493483  normal  0.0486677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1583  Sialate O-acetylesterase  46.32 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1155  sialate O-acetylesterase  41.9 
 
 		 492 aa  209  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2636  Sialate O-acetylesterase  41.63 
 
 		 499 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4857  Sialate O-acetylesterase  43.67 
 
 		 469 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000781027  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4232  sialate O-acetylesterase  42.06 
 
 		 511 aa  177  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1697  sialate O-acetylesterase  41.03 
 
 		 503 aa  170  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240139  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1034  Sialate O-acetylesterase  35.71 
 
 		 689 aa  165  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2743  Sialate O-acetylesterase  36.51 
 
 		 482 aa  163  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.917313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2783  Sialate O-acetylesterase  38.72 
 
 		 477 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000307514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4964  sialate O-acetylesterase  34.05 
 
 		 459 aa  150  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2622  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.29 
 
 		 521 aa  150  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4100  sialate O-acetylesterase  33.61 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2210  Sialate O-acetylesterase  35.08 
 
 		 466 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.32552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3021  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.91 
 
 		 501 aa  140  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000125756  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3770  Sialate O-acetylesterase  35.98 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0438855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0454  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.84 
 
 		 512 aa  137  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1315  Sialate O-acetylesterase  34.45 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1291  Sialate O-acetylesterase  36.32 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3252  Sialate O-acetylesterase  31.14 
 
 		 689 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656334 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1436  hypothetical protein  31.7 
 
 		 230 aa  108  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000109275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3540  hypothetical protein  33.61 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1891  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 		 362 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  24.31 
 
 		 940 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>