52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1628 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1628  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  100 
 
 
678 aa  1360    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1337  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  44.07 
 
 
650 aa  454  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.377113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1080  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.7 
 
 
652 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0773  protein of unknown function DUF303, acetylesterase putative  34.84 
 
 
648 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0312  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  37.5 
 
 
651 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3210  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.83 
 
 
666 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.238691  normal  0.254476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2722  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.23 
 
 
628 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1717  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.56 
 
 
642 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1262  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.28 
 
 
635 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4847  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.66 
 
 
637 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277703  hitchhiker  0.00343122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1852  glycoside hydrolase family protein  35.95 
 
 
638 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0760  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.95 
 
 
657 aa  356  7.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1304  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.98 
 
 
643 aa  340  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03853  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  34.73 
 
 
646 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2492  ExsB  31.33 
 
 
661 aa  306  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795062  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2658  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.48 
 
 
639 aa  302  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0830  sialic acid-specific 9-O-acetylesterase  31.09 
 
 
635 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174832  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2403  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.48 
 
 
644 aa  284  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22974  normal  0.390685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4232  sialate O-acetylesterase  48.47 
 
 
511 aa  257  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2636  Sialate O-acetylesterase  47.72 
 
 
499 aa  233  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2743  Sialate O-acetylesterase  45 
 
 
482 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.917313  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1583  Sialate O-acetylesterase  42.86 
 
 
486 aa  223  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4100  sialate O-acetylesterase  45.27 
 
 
474 aa  219  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2308  Sialate O-acetylesterase  41.7 
 
 
485 aa  213  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0493483  normal  0.0486677 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1155  sialate O-acetylesterase  47.26 
 
 
492 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1697  sialate O-acetylesterase  45.27 
 
 
503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240139  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2210  Sialate O-acetylesterase  39.43 
 
 
466 aa  197  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.32552  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4857  Sialate O-acetylesterase  44.05 
 
 
469 aa  197  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000781027  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1291  Sialate O-acetylesterase  42.91 
 
 
463 aa  191  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2783  Sialate O-acetylesterase  42.62 
 
 
477 aa  187  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000307514  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4964  sialate O-acetylesterase  40.17 
 
 
459 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1315  Sialate O-acetylesterase  40.93 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3770  Sialate O-acetylesterase  41.35 
 
 
468 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0438855  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1034  Sialate O-acetylesterase  37.02 
 
 
689 aa  163  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3021  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.17 
 
 
501 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000125756  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0454  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.73 
 
 
512 aa  130  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3252  Sialate O-acetylesterase  34.88 
 
 
689 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2622  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.02 
 
 
521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259122  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1436  hypothetical protein  29.02 
 
 
230 aa  94.4  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000109275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1891  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 
362 aa  83.2  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  35.11 
 
 
940 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3540  hypothetical protein  33.71 
 
 
478 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2089  Beta-glucuronidase  28.77 
 
 
132 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  30.86 
 
 
603 aa  44.3  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  30.86 
 
 
603 aa  44.3  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  30.86 
 
 
603 aa  44.3  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  30.86 
 
 
603 aa  44.3  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 
571 aa  44.3  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  30.86 
 
 
603 aa  44.3  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  30.86 
 
 
603 aa  44.3  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  30.86 
 
 
603 aa  43.9  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  30.86 
 
 
603 aa  43.9  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>