97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2089 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2089  Beta-glucuronidase  100 
 
 
132 aa  274  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  51.75 
 
 
601 aa  142  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  50 
 
 
577 aa  131  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  47.37 
 
 
603 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  47.37 
 
 
603 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  47.37 
 
 
603 aa  130  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  47.37 
 
 
603 aa  130  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  47.37 
 
 
603 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  47.37 
 
 
603 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  47.37 
 
 
603 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  47.37 
 
 
603 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  49.12 
 
 
598 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  47.62 
 
 
598 aa  122  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  44.74 
 
 
590 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  43.86 
 
 
603 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  46.49 
 
 
596 aa  110  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  42.48 
 
 
644 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  40.35 
 
 
599 aa  98.2  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  36.84 
 
 
588 aa  81.6  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  35.96 
 
 
651 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.09 
 
 
621 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.09 
 
 
614 aa  71.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.21 
 
 
614 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.74 
 
 
590 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.97 
 
 
980 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.75 
 
 
864 aa  64.3  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  29.63 
 
 
889 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  30.7 
 
 
563 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  32.23 
 
 
591 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3865  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.57 
 
 
918 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.160045  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  38.89 
 
 
894 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  34.15 
 
 
603 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  32.46 
 
 
564 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  31.93 
 
 
597 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.81 
 
 
892 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  27.83 
 
 
603 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.31 
 
 
1064 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  25.42 
 
 
677 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.63 
 
 
929 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.93 
 
 
640 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  35.44 
 
 
625 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  26.98 
 
 
613 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.29 
 
 
623 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.03 
 
 
575 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.86 
 
 
614 aa  50.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31 
 
 
923 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 
945 aa  50.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  37.93 
 
 
785 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  28.35 
 
 
645 aa  50.4  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  38.27 
 
 
604 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.96 
 
 
799 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  27.64 
 
 
1024 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
781 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  28.57 
 
 
686 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.71 
 
 
781 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  24.81 
 
 
598 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  32.2 
 
 
972 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  33.82 
 
 
607 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  29.63 
 
 
558 aa  47.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.96 
 
 
901 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 
593 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.22 
 
 
757 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 
623 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  33.71 
 
 
766 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3871  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.93 
 
 
924 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  29.37 
 
 
627 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  27.42 
 
 
1108 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.35 
 
 
620 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  28.35 
 
 
584 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  26.04 
 
 
763 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1628  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  28.77 
 
 
678 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  41.67 
 
 
602 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  24.8 
 
 
1076 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  27.34 
 
 
1059 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  27.5 
 
 
600 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3896  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.81 
 
 
951 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0623338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  24.35 
 
 
738 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.83 
 
 
905 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.55 
 
 
884 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.09 
 
 
609 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.55 
 
 
1088 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 
600 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 
1079 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.1 
 
 
750 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.61 
 
 
640 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  28.83 
 
 
670 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  24.35 
 
 
626 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 
655 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  35.56 
 
 
1063 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  25.2 
 
 
568 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.73 
 
 
1781 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  30.51 
 
 
1077 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 
806 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 
825 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  29.46 
 
 
704 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.84 
 
 
741 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  31.17 
 
 
587 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>