More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0022 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  54.7 
 
 		 799 aa  673    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  56.93 
 
 		 757 aa  740    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  51.98 
 
 		 800 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  53.13 
 
 		 905 aa  638    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 609 aa  1269    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  60.5 
 
 		 901 aa  766    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.32 
 
 		 884 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  43.77 
 
 		 603 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  44.28 
 
 		 614 aa  498  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.17 
 
 		 614 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.13 
 
 		 620 aa  482  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  42.61 
 
 		 980 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  41.68 
 
 		 640 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  43.2 
 
 		 864 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  45.05 
 
 		 575 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.47 
 
 		 1064 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.26 
 
 		 623 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  39.7 
 
 		 584 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  36.41 
 
 		 626 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  37.13 
 
 		 600 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.13 
 
 		 932 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.35 
 
 		 619 aa  363  5.0000000000000005e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  38.02 
 
 		 602 aa  361  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  35.04 
 
 		 613 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.88 
 
 		 590 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.64 
 
 		 614 aa  274  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.94 
 
 		 640 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  33.67 
 
 		 593 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33 
 
 		 614 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  33.16 
 
 		 623 aa  247  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.85 
 
 		 621 aa  247  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.83 
 
 		 595 aa  243  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  32.65 
 
 		 627 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  31.24 
 
 		 645 aa  219  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.42 
 
 		 892 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.53 
 
 		 651 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.47 
 
 		 604 aa  211  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  32.46 
 
 		 889 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.4 
 
 		 710 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 945 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.52 
 
 		 923 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.97 
 
 		 785 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.41 
 
 		 619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.53 
 
 		 858 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.13 
 
 		 929 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  28.41 
 
 		 717 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  30.56 
 
 		 704 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 803 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.35 
 
 		 794 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  29.82 
 
 		 707 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.35 
 
 		 750 aa  103  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  24.62 
 
 		 804 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25.88 
 
 		 1129 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 		 1175 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.68 
 
 		 808 aa  99.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25.37 
 
 		 804 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  26.85 
 
 		 590 aa  98.2  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  26.6 
 
 		 1045 aa  97.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  24.63 
 
 		 625 aa  97.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  25.99 
 
 		 1015 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  28.03 
 
 		 824 aa  95.9  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.53 
 
 		 1053 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.33 
 
 		 805 aa  95.5  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  28.05 
 
 		 940 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  23.59 
 
 		 743 aa  94.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.1 
 
 		 984 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.71 
 
 		 862 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.61 
 
 		 925 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25.26 
 
 		 1171 aa  94  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  24.15 
 
 		 738 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25.12 
 
 		 596 aa  93.6  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 		 806 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  25.13 
 
 		 951 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 		 984 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 916 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  26.53 
 
 		 813 aa  92  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.43 
 
 		 824 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  27.45 
 
 		 894 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 1185 aa  92  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  24.36 
 
 		 607 aa  90.9  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  25.07 
 
 		 928 aa  91.3  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  28.42 
 
 		 964 aa  90.9  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  24.19 
 
 		 563 aa  90.9  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  23.36 
 
 		 644 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  24.86 
 
 		 564 aa  88.6  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  23.64 
 
 		 601 aa  87.8  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.79 
 
 		 1019 aa  87.8  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  24.66 
 
 		 587 aa  87.4  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  26.55 
 
 		 597 aa  87  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.29 
 
 		 837 aa  87  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 754 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.83 
 
 		 805 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  26.37 
 
 		 677 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.15 
 
 		 972 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.37 
 
 		 813 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 		 932 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  23.54 
 
 		 1455 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 888 aa  85.5  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  25.8 
 
 		 604 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 		 724 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>