282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1330 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  74.12 
 
 
599 aa  970    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  100 
 
 
596 aa  1236    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  50.84 
 
 
588 aa  609  1e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  45.26 
 
 
598 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  44.04 
 
 
603 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  44.21 
 
 
603 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  44.21 
 
 
603 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  44.04 
 
 
603 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  44.21 
 
 
603 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  44.04 
 
 
603 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  44.37 
 
 
603 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  44.54 
 
 
603 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  44.21 
 
 
603 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  42.93 
 
 
644 aa  480  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  42.98 
 
 
598 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  41.46 
 
 
601 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  40.86 
 
 
590 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  42 
 
 
577 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  43.61 
 
 
512 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  33.89 
 
 
563 aa  308  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  33.84 
 
 
564 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  31.73 
 
 
558 aa  259  8e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  28.34 
 
 
587 aa  196  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  27.05 
 
 
591 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 
598 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.78 
 
 
607 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  26.95 
 
 
568 aa  183  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  25.67 
 
 
600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  27.62 
 
 
604 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.26 
 
 
625 aa  180  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  28.21 
 
 
670 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  28.01 
 
 
897 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  25.56 
 
 
707 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  27.1 
 
 
603 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 
888 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  27.78 
 
 
686 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0829  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  44.64 
 
 
188 aa  163  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.31 
 
 
717 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  24.55 
 
 
597 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  25.44 
 
 
704 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.11 
 
 
738 aa  151  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  26.38 
 
 
677 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  25 
 
 
894 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  24.28 
 
 
803 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  24.31 
 
 
862 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  24.88 
 
 
1076 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  27.79 
 
 
889 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  26.38 
 
 
1084 aa  141  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 
1084 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  24.7 
 
 
1019 aa  140  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 
806 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.16 
 
 
923 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.95 
 
 
1005 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.6 
 
 
986 aa  137  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.33 
 
 
1424 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  24.91 
 
 
1129 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.24 
 
 
743 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  22.07 
 
 
984 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  23.1 
 
 
848 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  26.41 
 
 
1355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  26.1 
 
 
1045 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.21 
 
 
1018 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  23.95 
 
 
824 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  23.91 
 
 
1024 aa  130  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.3 
 
 
805 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.58 
 
 
858 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  27.01 
 
 
1035 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 
805 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  25.45 
 
 
1012 aa  128  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  27.37 
 
 
804 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  27.06 
 
 
1046 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 
766 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  26.24 
 
 
750 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.49 
 
 
972 aa  127  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  26.5 
 
 
858 aa  127  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  24.53 
 
 
928 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  24.95 
 
 
1023 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 
1077 aa  125  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.92 
 
 
1033 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.82 
 
 
903 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  25.34 
 
 
1015 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
919 aa  124  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  25.62 
 
 
815 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.61 
 
 
1781 aa  122  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.84 
 
 
804 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.7 
 
 
920 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 
827 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
640 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.55 
 
 
748 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.23 
 
 
747 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.91 
 
 
884 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 
754 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.17 
 
 
1026 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25.95 
 
 
1455 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.46 
 
 
1041 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  22.82 
 
 
1059 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.97 
 
 
575 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 
1185 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  25.16 
 
 
1017 aa  117  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 
925 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>