287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2051 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 766 aa  1560    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.18 
 
 		 781 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 		 781 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  37.85 
 
 		 785 aa  535  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  39.27 
 
 		 763 aa  511  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.66 
 
 		 913 aa  335  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  30.63 
 
 		 743 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  30.6 
 
 		 750 aa  296  7e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 979 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  27.47 
 
 		 804 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 754 aa  251  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  27.32 
 
 		 804 aa  248  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.04 
 
 		 748 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.7 
 
 		 747 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  25.49 
 
 		 928 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.31 
 
 		 858 aa  209  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.12 
 
 		 986 aa  205  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 		 925 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.12 
 
 		 741 aa  197  9e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 803 aa  197  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.6 
 
 		 811 aa  191  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  31.6 
 
 		 894 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.38 
 
 		 707 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.44 
 
 		 805 aa  185  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 		 832 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.26 
 
 		 787 aa  177  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.04 
 
 		 862 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  33.9 
 
 		 932 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 873 aa  173  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.4 
 
 		 813 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  30.1 
 
 		 824 aa  171  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  24.85 
 
 		 848 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  32.17 
 
 		 888 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  32.92 
 
 		 972 aa  165  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 919 aa  164  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  26.62 
 
 		 859 aa  164  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  24.55 
 
 		 961 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  29.27 
 
 		 704 aa  158  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.69 
 
 		 922 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  27.54 
 
 		 1035 aa  154  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.17 
 
 		 824 aa  154  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  27.36 
 
 		 1015 aa  153  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 984 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.45 
 
 		 1129 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.54 
 
 		 1019 aa  149  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.43 
 
 		 794 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 		 987 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 		 807 aa  148  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 		 806 aa  148  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.58 
 
 		 805 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  27.11 
 
 		 897 aa  145  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  27.05 
 
 		 1044 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  25.77 
 
 		 1041 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  28.29 
 
 		 1050 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  28.29 
 
 		 1066 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.4 
 
 		 808 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  26.29 
 
 		 1108 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  28.29 
 
 		 1066 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  22.81 
 
 		 815 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.26 
 
 		 920 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.35 
 
 		 1026 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.97 
 
 		 717 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 799 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.58 
 
 		 903 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 		 825 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  25.06 
 
 		 1031 aa  137  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.54 
 
 		 882 aa  137  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.52 
 
 		 1781 aa  137  9e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.66 
 
 		 837 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  27.56 
 
 		 1063 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  22.4 
 
 		 1046 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  29.56 
 
 		 1036 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  22.82 
 
 		 1045 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  22.76 
 
 		 951 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 686 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  23.09 
 
 		 806 aa  132  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  24.65 
 
 		 1355 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25.34 
 
 		 1035 aa  131  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  21.38 
 
 		 1185 aa  131  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  29.2 
 
 		 1029 aa  131  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.2 
 
 		 1033 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  27.25 
 
 		 644 aa  130  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 		 1084 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.71 
 
 		 1030 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  27.09 
 
 		 1028 aa  129  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  28.5 
 
 		 829 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  25.59 
 
 		 577 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.03 
 
 		 1093 aa  128  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  27.16 
 
 		 891 aa  127  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  23.68 
 
 		 596 aa  127  8.000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  25.44 
 
 		 1084 aa  127  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 827 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.06 
 
 		 1033 aa  126  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  28.05 
 
 		 738 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  25.93 
 
 		 1043 aa  126  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  26.78 
 
 		 1032 aa  124  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  29.48 
 
 		 587 aa  124  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  26.23 
 
 		 1024 aa  124  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  25.52 
 
 		 1059 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  27.85 
 
 		 889 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>