294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3338 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  50.13 
 
 		 785 aa  747    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  98.72 
 
 		 781 aa  1601    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  58.91 
 
 		 763 aa  903    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 781 aa  1619    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 		 766 aa  545  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.62 
 
 		 913 aa  352  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.63 
 
 		 743 aa  300  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.36 
 
 		 750 aa  282  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  29.38 
 
 		 862 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 		 979 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 754 aa  214  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  27.25 
 
 		 804 aa  213  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  25.75 
 
 		 1015 aa  211  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.07 
 
 		 858 aa  211  6e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.1 
 
 		 741 aa  210  8e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.48 
 
 		 804 aa  206  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 888 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  26.35 
 
 		 932 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  32 
 
 		 894 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.77 
 
 		 794 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  22.21 
 
 		 984 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 806 aa  184  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 		 925 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.94 
 
 		 811 aa  181  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  25.76 
 
 		 897 aa  181  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.1 
 
 		 805 aa  181  5.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 		 832 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31 
 
 		 748 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31 
 
 		 747 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.73 
 
 		 922 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  27.96 
 
 		 859 aa  172  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.17 
 
 		 824 aa  171  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 806 aa  168  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  30.11 
 
 		 972 aa  168  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  30.62 
 
 		 803 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 		 807 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 829 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.35 
 
 		 707 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.68 
 
 		 986 aa  161  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.97 
 
 		 717 aa  160  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 825 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  23.71 
 
 		 961 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.4 
 
 		 837 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  24.09 
 
 		 848 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  27.48 
 
 		 928 aa  154  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.46 
 
 		 805 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 827 aa  154  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.35 
 
 		 813 aa  154  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.88 
 
 		 903 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  30.02 
 
 		 815 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  24.3 
 
 		 1355 aa  151  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  24.49 
 
 		 1019 aa  150  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  32.03 
 
 		 738 aa  151  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 919 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  25 
 
 		 704 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 		 858 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  29.59 
 
 		 686 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 		 1175 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.74 
 
 		 920 aa  144  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.68 
 
 		 824 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.31 
 
 		 787 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  28.87 
 
 		 598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 799 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 873 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 951 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  27.77 
 
 		 590 aa  137  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  27.42 
 
 		 1455 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 655 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  23.06 
 
 		 1185 aa  134  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.59 
 
 		 1033 aa  134  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  27.06 
 
 		 577 aa  134  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.97 
 
 		 1781 aa  133  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  28.34 
 
 		 603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  22.9 
 
 		 1171 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  28.34 
 
 		 603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 987 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  28.34 
 
 		 603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  28.88 
 
 		 603 aa  132  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.95 
 
 		 1093 aa  132  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  24.59 
 
 		 1108 aa  132  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  28.88 
 
 		 603 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  25.32 
 
 		 891 aa  130  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  24.04 
 
 		 1129 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  28.07 
 
 		 603 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  28.07 
 
 		 603 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.93 
 
 		 920 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  26.22 
 
 		 603 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  27.81 
 
 		 603 aa  129  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  25.35 
 
 		 1049 aa  129  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  27.97 
 
 		 603 aa  129  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  26.81 
 
 		 1063 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  29.84 
 
 		 625 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.93 
 
 		 882 aa  128  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  23.52 
 
 		 964 aa  127  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  25.1 
 
 		 601 aa  127  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.84 
 
 		 644 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 1079 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  28.01 
 
 		 558 aa  125  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  24.65 
 
 		 1020 aa  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.31 
 
 		 1600 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>