282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1016 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 805 aa  1679    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  42.72 
 
 		 832 aa  667    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  43.31 
 
 		 984 aa  628  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  42.61 
 
 		 925 aa  604  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  42.33 
 
 		 932 aa  598  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  36.11 
 
 		 964 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  35.24 
 
 		 1015 aa  482  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  35.71 
 
 		 961 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  35.63 
 
 		 827 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.54 
 
 		 805 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  35.92 
 
 		 928 aa  465  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.88 
 
 		 986 aa  461  9.999999999999999e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  37.28 
 
 		 806 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  31.6 
 
 		 873 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  32.79 
 
 		 919 aa  426  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.24 
 
 		 813 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.18 
 
 		 903 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.42 
 
 		 824 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.41 
 
 		 922 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.71 
 
 		 794 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.24 
 
 		 1781 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  30.04 
 
 		 1355 aa  358  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  31.36 
 
 		 1185 aa  356  8.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  30.94 
 
 		 891 aa  350  5e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.76 
 
 		 811 aa  340  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 		 806 aa  333  8e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 		 858 aa  318  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.36 
 
 		 837 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29 
 
 		 808 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.64 
 
 		 787 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 		 807 aa  304  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  29.3 
 
 		 859 aa  301  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  28.68 
 
 		 815 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  31.67 
 
 		 604 aa  287  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.57 
 
 		 1093 aa  280  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  29.17 
 
 		 862 aa  257  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 		 825 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 799 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  27.62 
 
 		 897 aa  248  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  27.44 
 
 		 743 aa  248  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 		 803 aa  240  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 829 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.41 
 
 		 750 aa  232  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  26.31 
 
 		 888 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.93 
 
 		 882 aa  216  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.39 
 
 		 707 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.19 
 
 		 824 aa  207  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.47 
 
 		 1171 aa  207  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  25.82 
 
 		 785 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.88 
 
 		 704 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  27.23 
 
 		 894 aa  203  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  26.05 
 
 		 848 aa  202  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 		 655 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  43.36 
 
 		 233 aa  196  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 		 979 aa  194  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 		 781 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 766 aa  190  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 1175 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.12 
 
 		 781 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.72 
 
 		 717 aa  170  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.49 
 
 		 972 aa  167  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.41 
 
 		 747 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  24.62 
 
 		 763 aa  163  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.79 
 
 		 913 aa  160  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.55 
 
 		 748 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.07 
 
 		 858 aa  160  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.85 
 
 		 1033 aa  158  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  24.65 
 
 		 804 aa  157  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 		 754 aa  157  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25 
 
 		 804 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25.68 
 
 		 1455 aa  147  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  30.75 
 
 		 987 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.32 
 
 		 1041 aa  145  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  26.86 
 
 		 1017 aa  143  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  28.19 
 
 		 558 aa  143  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  26.18 
 
 		 1035 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  27.17 
 
 		 738 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  24.95 
 
 		 1129 aa  140  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.64 
 
 		 741 aa  138  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  24.6 
 
 		 686 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.06 
 
 		 1013 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  27.13 
 
 		 587 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.78 
 
 		 920 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  22.65 
 
 		 1045 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  25.34 
 
 		 1008 aa  131  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  26.93 
 
 		 588 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.41 
 
 		 1026 aa  131  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  24.32 
 
 		 1044 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.74 
 
 		 1033 aa  130  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  24.5 
 
 		 1035 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 951 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.98 
 
 		 1264 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.62 
 
 		 644 aa  129  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  24.3 
 
 		 596 aa  128  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 		 1049 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  25.35 
 
 		 1020 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.31 
 
 		 1030 aa  127  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.15 
 
 		 1036 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.92 
 
 		 920 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.97 
 
 		 1030 aa  127  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>