More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0081 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 808 aa  1630    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  60.62 
 
 		 837 aa  1024    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.15 
 
 		 794 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  36.56 
 
 		 799 aa  539  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  34.94 
 
 		 825 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.76 
 
 		 811 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  35.65 
 
 		 829 aa  498  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  35.11 
 
 		 815 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.77 
 
 		 805 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.25 
 
 		 882 aa  399  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.74 
 
 		 986 aa  380  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 		 873 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 827 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 807 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.17 
 
 		 787 aa  357  5e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  30.27 
 
 		 928 aa  356  8.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.51 
 
 		 903 aa  353  8e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  28.96 
 
 		 1015 aa  346  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 		 806 aa  338  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  29.99 
 
 		 891 aa  333  8e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 806 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 832 aa  330  8e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 		 919 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  29.71 
 
 		 1355 aa  321  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 858 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.65 
 
 		 922 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.24 
 
 		 824 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.18 
 
 		 813 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  32.78 
 
 		 655 aa  300  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29 
 
 		 805 aa  300  6e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.14 
 
 		 1781 aa  289  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 		 932 aa  286  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 		 925 aa  285  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 		 1185 aa  282  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  27.46 
 
 		 859 aa  282  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  29.51 
 
 		 984 aa  273  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.76 
 
 		 1093 aa  270  7e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  27.78 
 
 		 961 aa  264  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  29.54 
 
 		 604 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  27.7 
 
 		 964 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.23 
 
 		 743 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.58 
 
 		 862 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.03 
 
 		 748 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.47 
 
 		 747 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  29.18 
 
 		 750 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.83 
 
 		 858 aa  155  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  31.15 
 
 		 804 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  23.31 
 
 		 897 aa  151  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  28.55 
 
 		 804 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 		 803 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  25.03 
 
 		 754 aa  149  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 766 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.73 
 
 		 824 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  23.6 
 
 		 979 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  27.75 
 
 		 686 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.97 
 
 		 972 aa  138  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.19 
 
 		 785 aa  135  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.92 
 
 		 1041 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.1 
 
 		 1026 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.25 
 
 		 913 aa  130  7.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.75 
 
 		 892 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.9 
 
 		 1030 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.01 
 
 		 738 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  25.81 
 
 		 894 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25 
 
 		 763 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.35 
 
 		 741 aa  125  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  25.82 
 
 		 1112 aa  123  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  30.36 
 
 		 564 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  29.97 
 
 		 563 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  25.12 
 
 		 1043 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  26.13 
 
 		 1044 aa  119  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.88 
 
 		 1033 aa  119  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  28.54 
 
 		 1024 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  22.59 
 
 		 707 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.51 
 
 		 884 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  25.85 
 
 		 1041 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  21.92 
 
 		 781 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  26.06 
 
 		 1171 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 987 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.58 
 
 		 1019 aa  115  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.92 
 
 		 781 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.7 
 
 		 1033 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  22.57 
 
 		 848 aa  115  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25.75 
 
 		 1455 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  24.36 
 
 		 1020 aa  114  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.51 
 
 		 1289 aa  113  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  25.69 
 
 		 670 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 1077 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.73 
 
 		 1030 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  25.74 
 
 		 1063 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  27.34 
 
 		 577 aa  112  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25.83 
 
 		 1035 aa  112  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.34 
 
 		 1018 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.65 
 
 		 1030 aa  111  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  24.94 
 
 		 1029 aa  111  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  27.32 
 
 		 588 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  25.22 
 
 		 1032 aa  110  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.32 
 
 		 1030 aa  110  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.32 
 
 		 1030 aa  110  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  24.46 
 
 		 704 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>