280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3159 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  53.82 
 
 		 829 aa  793    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  78.85 
 
 		 825 aa  1282    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 799 aa  1634    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  73.4 
 
 		 655 aa  759    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.74 
 
 		 837 aa  544  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.56 
 
 		 808 aa  539  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.41 
 
 		 794 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.61 
 
 		 882 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  36.04 
 
 		 811 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  33.99 
 
 		 815 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.73 
 
 		 903 aa  376  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  29.95 
 
 		 1015 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.21 
 
 		 805 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 806 aa  357  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  29.73 
 
 		 928 aa  353  8.999999999999999e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.7 
 
 		 922 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 		 873 aa  350  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 827 aa  349  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  30.82 
 
 		 919 aa  345  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.88 
 
 		 986 aa  335  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.16 
 
 		 807 aa  333  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  29.37 
 
 		 858 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  29.87 
 
 		 1355 aa  328  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  31.3 
 
 		 891 aa  324  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 		 806 aa  321  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.71 
 
 		 787 aa  317  7e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.08 
 
 		 813 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.47 
 
 		 1781 aa  309  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 832 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.2 
 
 		 824 aa  298  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  28.17 
 
 		 859 aa  297  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 1185 aa  278  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  30.76 
 
 		 604 aa  271  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.26 
 
 		 1093 aa  266  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 		 984 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 932 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  25.99 
 
 		 961 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 925 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.92 
 
 		 805 aa  246  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  27.05 
 
 		 964 aa  238  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.24 
 
 		 858 aa  171  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  28.42 
 
 		 750 aa  164  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  25.52 
 
 		 897 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.82 
 
 		 862 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  29.2 
 
 		 894 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.15 
 
 		 743 aa  146  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 803 aa  141  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.34 
 
 		 781 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 979 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 766 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 781 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.87 
 
 		 913 aa  134  9e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  24.91 
 
 		 707 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  30.39 
 
 		 785 aa  131  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 		 888 aa  127  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  29.12 
 
 		 763 aa  126  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  32.65 
 
 		 972 aa  124  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.89 
 
 		 704 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.27 
 
 		 824 aa  120  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  29.44 
 
 		 987 aa  117  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.25 
 
 		 563 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  25.21 
 
 		 804 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25.47 
 
 		 804 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  26.2 
 
 		 1129 aa  114  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  25.69 
 
 		 564 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 951 aa  112  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  25.58 
 
 		 848 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.72 
 
 		 920 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.76 
 
 		 1171 aa  108  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 754 aa  108  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  20.81 
 
 		 741 aa  107  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  25.06 
 
 		 738 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  24.39 
 
 		 1455 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.66 
 
 		 748 aa  105  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  25.34 
 
 		 1020 aa  105  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.53 
 
 		 1030 aa  103  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.71 
 
 		 920 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  25.81 
 
 		 607 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.06 
 
 		 623 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.23 
 
 		 1041 aa  103  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  23.56 
 
 		 1024 aa  103  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  24.94 
 
 		 1019 aa  102  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  27.05 
 
 		 1044 aa  102  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  28.29 
 
 		 1050 aa  101  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  28.29 
 
 		 1066 aa  101  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  28.29 
 
 		 1066 aa  101  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.52 
 
 		 1005 aa  101  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25.24 
 
 		 596 aa  100  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.08 
 
 		 1026 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.13 
 
 		 1030 aa  99  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  22.89 
 
 		 599 aa  99  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  27.51 
 
 		 1029 aa  99.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  25.14 
 
 		 1076 aa  99.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25 
 
 		 1264 aa  99  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 1043 aa  99  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  24.76 
 
 		 1043 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  25.26 
 
 		 1059 aa  99.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  31.11 
 
 		 1028 aa  98.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.13 
 
 		 1030 aa  97.8  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  27.45 
 
 		 1041 aa  97.4  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>