More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3122 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  100 
 
 		 972 aa  1955    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.93 
 
 		 1033 aa  247  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  33.08 
 
 		 1063 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25.47 
 
 		 1455 aa  220  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  30.02 
 
 		 1129 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  29.33 
 
 		 1020 aa  204  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  30.07 
 
 		 1084 aa  204  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.9 
 
 		 1041 aa  204  9e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.38 
 
 		 1264 aa  203  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  27.3 
 
 		 1024 aa  201  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.45 
 
 		 1108 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  27.95 
 
 		 1076 aa  197  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 		 1084 aa  197  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 1079 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  33.23 
 
 		 1003 aa  195  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  24.58 
 
 		 1019 aa  195  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.99 
 
 		 1013 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 1077 aa  194  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 1094 aa  194  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.79 
 
 		 1004 aa  187  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  26.71 
 
 		 1044 aa  187  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  26.32 
 
 		 1059 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  30.34 
 
 		 859 aa  184  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 		 1043 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  27.88 
 
 		 1043 aa  183  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  29.36 
 
 		 1035 aa  181  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  32.44 
 
 		 607 aa  181  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  29.29 
 
 		 1032 aa  181  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  28.59 
 
 		 1022 aa  180  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  25.36 
 
 		 1045 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  29.28 
 
 		 1112 aa  179  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.47 
 
 		 1289 aa  179  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.78 
 
 		 1030 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  26.27 
 
 		 1049 aa  174  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.07 
 
 		 1018 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.16 
 
 		 1030 aa  172  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  28.27 
 
 		 1023 aa  172  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  28.21 
 
 		 1041 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.36 
 
 		 1030 aa  171  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.36 
 
 		 1030 aa  171  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.36 
 
 		 1030 aa  171  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  28.48 
 
 		 1030 aa  171  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1030 aa  171  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  33.5 
 
 		 625 aa  171  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.36 
 
 		 1030 aa  171  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.15 
 
 		 1053 aa  170  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  25.19 
 
 		 1046 aa  170  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.36 
 
 		 1030 aa  169  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  24.7 
 
 		 1036 aa  169  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  29.26 
 
 		 600 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  29.24 
 
 		 1017 aa  169  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.04 
 
 		 1036 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 738 aa  168  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.54 
 
 		 743 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.71 
 
 		 1424 aa  167  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 		 781 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.11 
 
 		 781 aa  167  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.62 
 
 		 1005 aa  167  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  28.45 
 
 		 1008 aa  167  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.13 
 
 		 996 aa  167  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.22 
 
 		 1030 aa  167  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.44 
 
 		 787 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.49 
 
 		 805 aa  167  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  34.81 
 
 		 587 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  32.92 
 
 		 766 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.26 
 
 		 1026 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 		 1017 aa  164  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  32.2 
 
 		 932 aa  164  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  27.29 
 
 		 1023 aa  164  9e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.45 
 
 		 750 aa  164  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  28.71 
 
 		 1030 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  29.79 
 
 		 858 aa  162  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  35.26 
 
 		 604 aa  161  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.49 
 
 		 1003 aa  161  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.89 
 
 		 811 aa  160  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  28.2 
 
 		 1012 aa  160  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  28.61 
 
 		 984 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 1020 aa  159  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 		 951 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  29.88 
 
 		 832 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  24.85 
 
 		 1035 aa  159  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  28.8 
 
 		 848 aa  159  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.63 
 
 		 992 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  29.77 
 
 		 598 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 925 aa  157  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.44 
 
 		 1329 aa  157  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.74 
 
 		 805 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  28.02 
 
 		 1028 aa  156  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  27.92 
 
 		 1066 aa  155  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  27.92 
 
 		 1050 aa  155  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.92 
 
 		 824 aa  155  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  27.92 
 
 		 1066 aa  155  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 		 987 aa  154  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  25.39 
 
 		 1164 aa  154  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  26.93 
 
 		 1024 aa  154  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  30.99 
 
 		 597 aa  154  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 		 1045 aa  154  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  31.74 
 
 		 763 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  26.99 
 
 		 1012 aa  153  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  27.49 
 
 		 1031 aa  152  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>