285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3193 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
825 aa  1684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  89.92 
 
 
655 aa  962    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  51.59 
 
 
829 aa  796    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  78.85 
 
 
799 aa  1315    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.66 
 
 
837 aa  538  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.94 
 
 
808 aa  530  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.54 
 
 
794 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.06 
 
 
811 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.85 
 
 
882 aa  487  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  35.25 
 
 
815 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.74 
 
 
805 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.26 
 
 
903 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  31.08 
 
 
1015 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.56 
 
 
922 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 
806 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  30.11 
 
 
928 aa  364  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  31.87 
 
 
873 aa  363  6e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 
827 aa  363  9e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
919 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 
807 aa  354  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  29.47 
 
 
1355 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.77 
 
 
986 aa  337  3.9999999999999995e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  31.38 
 
 
891 aa  332  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 
858 aa  330  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.58 
 
 
787 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.47 
 
 
813 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 
1185 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 
806 aa  321  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  30.15 
 
 
832 aa  320  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.81 
 
 
824 aa  317  5e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.76 
 
 
1781 aa  314  4.999999999999999e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  27.92 
 
 
859 aa  311  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  31.99 
 
 
604 aa  287  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 
925 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 
984 aa  268  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 
932 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.01 
 
 
1093 aa  259  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  26 
 
 
961 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  28.27 
 
 
964 aa  251  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.39 
 
 
805 aa  251  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  28.54 
 
 
862 aa  178  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.26 
 
 
858 aa  171  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  28.15 
 
 
750 aa  171  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  24.72 
 
 
897 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  30.22 
 
 
894 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.12 
 
 
781 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 
781 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 
979 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 
888 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  29.29 
 
 
743 aa  151  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  29.27 
 
 
704 aa  147  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 
803 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.77 
 
 
707 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  30.22 
 
 
785 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.65 
 
 
913 aa  141  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 
766 aa  139  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  26.73 
 
 
763 aa  132  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.65 
 
 
972 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.8 
 
 
563 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.88 
 
 
748 aa  129  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  29.01 
 
 
564 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.14 
 
 
747 aa  127  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.69 
 
 
824 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
754 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  28.05 
 
 
1171 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  26.16 
 
 
1129 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.64 
 
 
920 aa  120  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  30.36 
 
 
987 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  26.41 
 
 
848 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  29.62 
 
 
951 aa  118  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  23.65 
 
 
1175 aa  118  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  24.37 
 
 
804 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.31 
 
 
741 aa  115  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.81 
 
 
1013 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.37 
 
 
623 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  24.11 
 
 
804 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  27.3 
 
 
1020 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  26.63 
 
 
1043 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  27.51 
 
 
738 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25 
 
 
596 aa  108  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.65 
 
 
1019 aa  108  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.27 
 
 
920 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  28.01 
 
 
1041 aa  106  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.03 
 
 
1033 aa  107  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  25.46 
 
 
1076 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 
1043 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  24.27 
 
 
1024 aa  106  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 
1079 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  26.18 
 
 
1044 aa  106  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.73 
 
 
603 aa  105  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  25.06 
 
 
1035 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.74 
 
 
1026 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  23.42 
 
 
717 aa  104  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.63 
 
 
1264 aa  104  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.57 
 
 
1005 aa  103  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  26.71 
 
 
1032 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.37 
 
 
1030 aa  103  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.63 
 
 
1030 aa  101  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  23.34 
 
 
1455 aa  101  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  28.16 
 
 
1028 aa  100  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>