274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0951 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  44.55 
 
 
747 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  100 
 
 
741 aa  1530    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  44.81 
 
 
748 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  42.44 
 
 
754 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  42.24 
 
 
804 aa  618  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  42.24 
 
 
804 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  42.61 
 
 
743 aa  554  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  42.18 
 
 
750 aa  545  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.64 
 
 
785 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  26.42 
 
 
763 aa  220  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.1 
 
 
781 aa  210  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.97 
 
 
781 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.6 
 
 
913 aa  199  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 
766 aa  197  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 
979 aa  180  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  32.81 
 
 
803 aa  180  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  29.72 
 
 
848 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.69 
 
 
862 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.73 
 
 
805 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.32 
 
 
738 aa  161  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  32.65 
 
 
951 aa  155  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.78 
 
 
563 aa  154  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  26.64 
 
 
564 aa  153  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  25.56 
 
 
568 aa  152  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.01 
 
 
587 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  27.22 
 
 
597 aa  150  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.07 
 
 
894 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.45 
 
 
972 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.92 
 
 
920 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.32 
 
 
858 aa  145  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.53 
 
 
1289 aa  144  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  28.82 
 
 
591 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  23.54 
 
 
686 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.02 
 
 
992 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  27.27 
 
 
824 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  24.81 
 
 
806 aa  139  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  26.87 
 
 
1129 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 
987 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  27.2 
 
 
600 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  23.29 
 
 
827 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29 
 
 
920 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.38 
 
 
1026 aa  135  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.06 
 
 
1018 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.5 
 
 
598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.64 
 
 
805 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.91 
 
 
837 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  27.34 
 
 
897 aa  132  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.78 
 
 
992 aa  132  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.24 
 
 
607 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  25.1 
 
 
604 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.82 
 
 
986 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  23.78 
 
 
932 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 
984 aa  128  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  27.76 
 
 
603 aa  127  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 
1020 aa  127  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  25.83 
 
 
928 aa  127  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.57 
 
 
968 aa  127  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.87 
 
 
824 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 
858 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  30.28 
 
 
1355 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.35 
 
 
808 aa  125  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  29.51 
 
 
1079 aa  124  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.28 
 
 
625 aa  124  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  21.32 
 
 
903 aa  124  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 
806 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.45 
 
 
811 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  25.87 
 
 
1044 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  22.88 
 
 
832 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.01 
 
 
707 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  27.03 
 
 
1019 aa  121  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.45 
 
 
1013 aa  121  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.51 
 
 
1004 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.09 
 
 
1003 aa  121  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  26.8 
 
 
1035 aa  120  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  27.75 
 
 
859 aa  120  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  25.55 
 
 
558 aa  120  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  21.12 
 
 
919 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.15 
 
 
813 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  25.63 
 
 
1041 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  26.56 
 
 
1032 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  25 
 
 
1084 aa  119  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  22.91 
 
 
964 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  24.44 
 
 
1003 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.67 
 
 
892 aa  119  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.7 
 
 
1781 aa  118  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  21.04 
 
 
891 aa  118  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.54 
 
 
923 aa  118  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.88 
 
 
1041 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  23.08 
 
 
717 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  22.91 
 
 
961 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  26.65 
 
 
577 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  25.18 
 
 
704 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  22.24 
 
 
925 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.89 
 
 
1093 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.81 
 
 
1030 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  26.11 
 
 
1045 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.15 
 
 
794 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.45 
 
 
1033 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 
825 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>