296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00275 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  49.09 
 
 		 1043 aa  994    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  51.14 
 
 		 1024 aa  1009    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  51.14 
 
 		 1024 aa  1009    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  47.16 
 
 		 1066 aa  1002    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  50.38 
 
 		 1024 aa  998    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  47.43 
 
 		 1050 aa  1004    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  51.14 
 
 		 1024 aa  1009    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  38.48 
 
 		 1084 aa  698    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  50.95 
 
 		 1024 aa  1004    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  50.48 
 
 		 1024 aa  1010    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  100 
 
 		 1041 aa  2180    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  36.75 
 
 		 1079 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  37.01 
 
 		 1063 aa  657    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  48.8 
 
 		 1032 aa  1003    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  45.17 
 
 		 1031 aa  909    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  45.27 
 
 		 1036 aa  886    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  51.86 
 
 		 1035 aa  1086    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  38.18 
 
 		 1164 aa  686    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  50.62 
 
 		 1028 aa  1024    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  39.04 
 
 		 1033 aa  682    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  49.66 
 
 		 1044 aa  1033    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  49.09 
 
 		 1036 aa  988    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  37.85 
 
 		 1084 aa  669    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  49.04 
 
 		 1043 aa  997    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  47.16 
 
 		 1066 aa  1001    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  48.32 
 
 		 1029 aa  998    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  50.95 
 
 		 1024 aa  1008    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  51.05 
 
 		 1024 aa  1010    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.96 
 
 		 1026 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  36.91 
 
 		 1019 aa  632  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  35.1 
 
 		 1108 aa  624  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  36.12 
 
 		 1049 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.14 
 
 		 1033 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  35.72 
 
 		 1129 aa  611  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 		 1043 aa  608  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  35.33 
 
 		 1455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  35.69 
 
 		 1020 aa  599  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  35.03 
 
 		 1024 aa  594  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  35.18 
 
 		 1043 aa  588  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  33.9 
 
 		 1046 aa  584  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  34.35 
 
 		 1045 aa  580  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.28 
 
 		 1041 aa  570  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  34.57 
 
 		 1077 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  33.64 
 
 		 1076 aa  570  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.88 
 
 		 1013 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  36.08 
 
 		 1023 aa  568  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  34.11 
 
 		 1045 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  34.81 
 
 		 1059 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 		 1094 aa  560  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.54 
 
 		 1030 aa  543  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.54 
 
 		 1030 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.58 
 
 		 1030 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  33.83 
 
 		 1030 aa  540  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  32.54 
 
 		 1030 aa  542  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.54 
 
 		 1030 aa  542  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  32.54 
 
 		 1030 aa  542  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.54 
 
 		 1030 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.45 
 
 		 1030 aa  542  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  34.81 
 
 		 1003 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.26 
 
 		 1030 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  31.72 
 
 		 1032 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  31.69 
 
 		 1035 aa  530  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.09 
 
 		 1030 aa  528  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.47 
 
 		 1003 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.03 
 
 		 1018 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.73 
 
 		 968 aa  507  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.08 
 
 		 1036 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.79 
 
 		 1053 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  32.54 
 
 		 1026 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  33.8 
 
 		 1112 aa  490  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  32.54 
 
 		 1008 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.6 
 
 		 992 aa  484  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  31.69 
 
 		 1020 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  32.98 
 
 		 1012 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.08 
 
 		 1264 aa  478  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.56 
 
 		 1289 aa  476  1e-132  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  32.28 
 
 		 1023 aa  474  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  29.44 
 
 		 1009 aa  466  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  29.2 
 
 		 1012 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.61 
 
 		 1004 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.96 
 
 		 1005 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.43 
 
 		 992 aa  446  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  31.96 
 
 		 1021 aa  445  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 		 1022 aa  432  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.99 
 
 		 1329 aa  418  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  28.98 
 
 		 1017 aa  410  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 		 1017 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 		 640 aa  373  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.31 
 
 		 1424 aa  365  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  35.59 
 
 		 996 aa  358  2.9999999999999997e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  33.39 
 
 		 628 aa  340  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  42.08 
 
 		 349 aa  269  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.88 
 
 		 1600 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.85 
 
 		 920 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 		 987 aa  185  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.13 
 
 		 920 aa  171  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.21 
 
 		 972 aa  171  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46582  predicted protein  27.12 
 
 		 561 aa  156  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.47 
 
 		 805 aa  151  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 		 803 aa  148  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>