More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1689 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  93.06 
 
 		 564 aa  1093    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  100 
 
 		 563 aa  1160    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  40 
 
 		 577 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.13 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  36.59 
 
 		 603 aa  359  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  44.76 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  36.69 
 
 		 598 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  35.1 
 
 		 603 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  35.1 
 
 		 603 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  35.1 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  35.1 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  34.93 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  35.1 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  35.1 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  35.1 
 
 		 603 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  38.22 
 
 		 558 aa  340  5e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  35.71 
 
 		 590 aa  340  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  35.86 
 
 		 588 aa  335  9e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  34.49 
 
 		 601 aa  335  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  34.77 
 
 		 644 aa  329  9e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  33.89 
 
 		 596 aa  308  3e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  33 
 
 		 599 aa  298  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  31.4 
 
 		 597 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  30.65 
 
 		 625 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  30.35 
 
 		 598 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  30.99 
 
 		 604 aa  224  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  30.67 
 
 		 607 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  30.83 
 
 		 600 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  30.08 
 
 		 591 aa  211  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.79 
 
 		 587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.28 
 
 		 603 aa  196  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  28.9 
 
 		 738 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  27.5 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.47 
 
 		 747 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.03 
 
 		 748 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.09 
 
 		 894 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  29.14 
 
 		 743 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  27.03 
 
 		 897 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 888 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  32.58 
 
 		 1084 aa  158  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 		 754 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 803 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.42 
 
 		 707 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  32.72 
 
 		 1084 aa  157  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.78 
 
 		 741 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.61 
 
 		 717 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  28.43 
 
 		 686 aa  153  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  29.59 
 
 		 1043 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.9 
 
 		 862 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  25.37 
 
 		 677 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  29.22 
 
 		 1024 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.41 
 
 		 923 aa  143  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  31.03 
 
 		 1019 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.42 
 
 		 913 aa  142  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  25.47 
 
 		 670 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.59 
 
 		 805 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  28.28 
 
 		 750 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  29.52 
 
 		 1028 aa  140  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.31 
 
 		 1041 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  29.59 
 
 		 1032 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.72 
 
 		 815 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.57 
 
 		 804 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  28.8 
 
 		 1059 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  24.96 
 
 		 824 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.78 
 
 		 992 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  26.93 
 
 		 1035 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.38 
 
 		 804 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  25.4 
 
 		 704 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  28.35 
 
 		 1031 aa  135  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  29.9 
 
 		 1129 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  29.38 
 
 		 984 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  29.06 
 
 		 1020 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.6 
 
 		 1033 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.87 
 
 		 837 aa  134  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.39 
 
 		 986 aa  133  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 1077 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  28.28 
 
 		 1076 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  27.69 
 
 		 1063 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  27.63 
 
 		 1041 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.73 
 
 		 972 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  28.12 
 
 		 1108 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.09 
 
 		 1171 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 825 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  28.67 
 
 		 1024 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  28.67 
 
 		 1024 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  28.67 
 
 		 1024 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.67 
 
 		 1024 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1024 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.76 
 
 		 858 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.09 
 
 		 1033 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  27.88 
 
 		 785 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 		 1043 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.16 
 
 		 1036 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 1045 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  28.67 
 
 		 1024 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 		 827 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  29.04 
 
 		 1029 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 655 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  26.58 
 
 		 1050 aa  127  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  26.58 
 
 		 1066 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>