291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0530 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  100 
 
 		 591 aa  1224    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  47.32 
 
 		 603 aa  557  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  42.68 
 
 		 607 aa  458  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  40.29 
 
 		 597 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  39.61 
 
 		 604 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  41.14 
 
 		 600 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  42.21 
 
 		 598 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  41.48 
 
 		 625 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  39.33 
 
 		 568 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  37.24 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  30.58 
 
 		 558 aa  216  9e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  30.08 
 
 		 563 aa  211  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  29.4 
 
 		 564 aa  207  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  26.22 
 
 		 590 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  27.05 
 
 		 596 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  27.63 
 
 		 599 aa  195  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  29.74 
 
 		 577 aa  193  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  28.87 
 
 		 686 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  26.97 
 
 		 603 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  26.97 
 
 		 603 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  26.97 
 
 		 603 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  26.97 
 
 		 603 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.22 
 
 		 598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  26.97 
 
 		 603 aa  191  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  27.23 
 
 		 603 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  26.81 
 
 		 603 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  26.81 
 
 		 603 aa  189  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  26.81 
 
 		 603 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.59 
 
 		 644 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  28.18 
 
 		 738 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26 
 
 		 824 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  26.5 
 
 		 670 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  27.56 
 
 		 588 aa  182  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  27.13 
 
 		 601 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  26.06 
 
 		 848 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.91 
 
 		 862 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 803 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  25.44 
 
 		 707 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  26.69 
 
 		 897 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  24.54 
 
 		 888 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  27.55 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.51 
 
 		 923 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  24.96 
 
 		 677 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.36 
 
 		 717 aa  156  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  24.96 
 
 		 704 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  27.16 
 
 		 894 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  25.76 
 
 		 889 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.21 
 
 		 972 aa  150  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.82 
 
 		 741 aa  143  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  24.44 
 
 		 598 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  28.04 
 
 		 928 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.85 
 
 		 1041 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.8 
 
 		 804 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  29.5 
 
 		 804 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  29.8 
 
 		 743 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  25.15 
 
 		 1023 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  27.89 
 
 		 1026 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  24.9 
 
 		 1024 aa  130  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  28.93 
 
 		 750 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.05 
 
 		 1033 aa  130  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 815 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.78 
 
 		 1018 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  24.01 
 
 		 1129 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.42 
 
 		 1424 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  25.88 
 
 		 1003 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.79 
 
 		 892 aa  127  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.89 
 
 		 1013 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.5 
 
 		 1004 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 806 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.62 
 
 		 805 aa  124  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  26.25 
 
 		 1041 aa  124  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.34 
 
 		 1026 aa  124  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  25.33 
 
 		 1084 aa  124  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  27.79 
 
 		 785 aa  123  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  23.32 
 
 		 1059 aa  123  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 1084 aa  123  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  23.64 
 
 		 1045 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.3 
 
 		 805 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  23.76 
 
 		 1017 aa  122  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 987 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.22 
 
 		 992 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  23.79 
 
 		 1046 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.76 
 
 		 968 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  27.14 
 
 		 1012 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.98 
 
 		 1093 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  25.12 
 
 		 1019 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.44 
 
 		 1264 aa  120  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.2 
 
 		 748 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 		 1045 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.4 
 
 		 1600 aa  120  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.14 
 
 		 640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.94 
 
 		 996 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.2 
 
 		 747 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  23.79 
 
 		 1063 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25 
 
 		 1035 aa  118  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  24.4 
 
 		 1032 aa  117  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  22.79 
 
 		 1077 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.7 
 
 		 824 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.56 
 
 		 781 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.93 
 
 		 781 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>