More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2424 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  100 
 
 		 964 aa  1938    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  49.5 
 
 		 961 aa  880    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  41.99 
 
 		 832 aa  556  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 984 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  39.92 
 
 		 932 aa  494  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.11 
 
 		 805 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  36.31 
 
 		 925 aa  463  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  33.5 
 
 		 1015 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  33.03 
 
 		 827 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  34.39 
 
 		 928 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.72 
 
 		 805 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  32.81 
 
 		 806 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.27 
 
 		 903 aa  393  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  33.37 
 
 		 919 aa  386  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  33.38 
 
 		 873 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.12 
 
 		 986 aa  385  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.54 
 
 		 813 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.78 
 
 		 1781 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  29.87 
 
 		 1355 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  31.45 
 
 		 891 aa  354  4e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.77 
 
 		 824 aa  353  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.36 
 
 		 922 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.04 
 
 		 794 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.57 
 
 		 811 aa  340  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.31 
 
 		 787 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 		 1185 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 806 aa  315  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  28.64 
 
 		 815 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.02 
 
 		 807 aa  284  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  28.55 
 
 		 859 aa  271  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  31.61 
 
 		 604 aa  270  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.78 
 
 		 837 aa  269  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.65 
 
 		 1093 aa  266  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 858 aa  265  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.22 
 
 		 808 aa  253  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  28.36 
 
 		 825 aa  245  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 799 aa  243  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 829 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.84 
 
 		 882 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  28.89 
 
 		 717 aa  204  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  26.85 
 
 		 897 aa  201  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.99 
 
 		 862 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  29.38 
 
 		 707 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  28.86 
 
 		 704 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.2 
 
 		 743 aa  189  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  27.58 
 
 		 888 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.35 
 
 		 858 aa  176  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 803 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.36 
 
 		 750 aa  167  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.07 
 
 		 894 aa  165  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 		 655 aa  164  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.96 
 
 		 1264 aa  158  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  29.19 
 
 		 1171 aa  149  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  37.99 
 
 		 233 aa  148  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  27.97 
 
 		 738 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  22.96 
 
 		 848 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25 
 
 		 824 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.56 
 
 		 913 aa  145  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.6 
 
 		 1289 aa  144  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.85 
 
 		 1013 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  25.52 
 
 		 1020 aa  138  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.99 
 
 		 1030 aa  138  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.41 
 
 		 972 aa  138  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  25.46 
 
 		 1108 aa  138  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25.34 
 
 		 1175 aa  138  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  29.58 
 
 		 1030 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  29.58 
 
 		 1030 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.41 
 
 		 1026 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  29.32 
 
 		 1030 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.32 
 
 		 1030 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  29.32 
 
 		 1030 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1030 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  29.32 
 
 		 1030 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  28.57 
 
 		 597 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.31 
 
 		 607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  24.14 
 
 		 763 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.25 
 
 		 1077 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  27.82 
 
 		 1063 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.54 
 
 		 1036 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  24.91 
 
 		 1043 aa  131  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  26.35 
 
 		 598 aa  131  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25.81 
 
 		 1035 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 781 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 979 aa  127  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  26.81 
 
 		 1032 aa  127  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  26.4 
 
 		 1023 aa  127  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.85 
 
 		 1033 aa  127  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  23.83 
 
 		 785 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  25.09 
 
 		 1044 aa  125  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 754 aa  125  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  25.57 
 
 		 686 aa  125  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 		 766 aa  124  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  27.41 
 
 		 1084 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  24.18 
 
 		 1076 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  26.95 
 
 		 1008 aa  124  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.05 
 
 		 741 aa  123  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  28.19 
 
 		 1017 aa  122  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 1079 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.89 
 
 		 1053 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.71 
 
 		 747 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>