More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20590 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 
892 aa  1826    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  35.75 
 
 
889 aa  548  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.57 
 
 
923 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.63 
 
 
590 aa  299  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  30.54 
 
 
945 aa  274  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.39 
 
 
640 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 
593 aa  248  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  30.51 
 
 
645 aa  246  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.79 
 
 
595 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  36.51 
 
 
627 aa  242  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.62 
 
 
905 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.68 
 
 
884 aa  238  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 
623 aa  238  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.91 
 
 
757 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.2 
 
 
799 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.46 
 
 
901 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  30.36 
 
 
603 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.12 
 
 
800 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.53 
 
 
623 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.95 
 
 
640 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.53 
 
 
710 aa  219  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.42 
 
 
609 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.89 
 
 
620 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.01 
 
 
614 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.77 
 
 
864 aa  213  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 
626 aa  207  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.95 
 
 
929 aa  206  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.66 
 
 
614 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.98 
 
 
604 aa  204  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.12 
 
 
575 aa  200  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.39 
 
 
619 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.93 
 
 
980 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.27 
 
 
614 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.56 
 
 
1064 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  29.69 
 
 
686 aa  191  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.41 
 
 
602 aa  191  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.02 
 
 
619 aa  188  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.64 
 
 
651 aa  187  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  32.78 
 
 
600 aa  187  8e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.38 
 
 
621 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0165303 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  31.91 
 
 
613 aa  180  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  32.35 
 
 
738 aa  180  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.37 
 
 
614 aa  173  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  28.63 
 
 
584 aa  165  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.59 
 
 
932 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  29.1 
 
 
597 aa  155  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 
598 aa  154  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.04 
 
 
625 aa  152  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  28.23 
 
 
600 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.19 
 
 
607 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  32.51 
 
 
803 aa  146  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  24.85 
 
 
603 aa  144  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  27.41 
 
 
604 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.47 
 
 
750 aa  140  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  29.07 
 
 
568 aa  138  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  27.76 
 
 
587 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.92 
 
 
744 aa  134  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  27.01 
 
 
1031 aa  134  7.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.6 
 
 
743 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  27.29 
 
 
1036 aa  133  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  25.89 
 
 
603 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.45 
 
 
1026 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.27 
 
 
862 aa  130  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 
932 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 
1077 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.67 
 
 
808 aa  127  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  26.9 
 
 
591 aa  127  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25.09 
 
 
804 aa  127  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 
925 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  26.41 
 
 
1029 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.54 
 
 
811 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  25.98 
 
 
804 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  26.71 
 
 
1455 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  25.97 
 
 
1063 aa  124  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  25.27 
 
 
1024 aa  123  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  25.85 
 
 
1028 aa  123  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.81 
 
 
805 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  26.34 
 
 
1045 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  26.67 
 
 
1041 aa  121  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  25.82 
 
 
972 aa  121  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.63 
 
 
748 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  25.33 
 
 
1108 aa  120  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  24.74 
 
 
1066 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  24.74 
 
 
1050 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  29.63 
 
 
1046 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  24.74 
 
 
1066 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  25.64 
 
 
1059 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  25.57 
 
 
603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.89 
 
 
824 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  25.36 
 
 
603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 
984 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  25.57 
 
 
603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  28.44 
 
 
1171 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  25.57 
 
 
603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  26.27 
 
 
754 aa  119  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  25.57 
 
 
603 aa  119  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.67 
 
 
741 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  27.09 
 
 
928 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  24.69 
 
 
603 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  21.61 
 
 
916 aa  118  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>