276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4066 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  100 
 
 
590 aa  1226    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  40.88 
 
 
593 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.15 
 
 
640 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.98 
 
 
595 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  39.69 
 
 
623 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 
627 aa  452  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  37.95 
 
 
645 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.46 
 
 
710 aa  395  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.12 
 
 
604 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.01 
 
 
621 aa  333  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.11 
 
 
614 aa  330  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.73 
 
 
614 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  34.9 
 
 
603 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.66 
 
 
884 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.17 
 
 
905 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.63 
 
 
892 aa  299  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.4 
 
 
651 aa  297  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.87 
 
 
620 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.43 
 
 
640 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.31 
 
 
623 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.33 
 
 
799 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.72 
 
 
757 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.94 
 
 
800 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.88 
 
 
609 aa  280  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.51 
 
 
614 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.78 
 
 
901 aa  280  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.34 
 
 
575 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.76 
 
 
614 aa  267  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.98 
 
 
980 aa  266  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.18 
 
 
864 aa  263  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  29.11 
 
 
889 aa  259  8e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.4 
 
 
1064 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.98 
 
 
602 aa  247  4e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  31.29 
 
 
600 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  30.42 
 
 
626 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 
945 aa  236  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.94 
 
 
619 aa  234  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  29.53 
 
 
584 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.04 
 
 
932 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  29.41 
 
 
613 aa  224  4.9999999999999996e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.16 
 
 
923 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.46 
 
 
619 aa  177  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.05 
 
 
743 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  26.55 
 
 
607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.59 
 
 
598 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  26.17 
 
 
750 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  22.51 
 
 
686 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.82 
 
 
600 aa  110  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  24.04 
 
 
597 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.94 
 
 
1019 aa  110  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 
803 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.24 
 
 
837 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.78 
 
 
808 aa  107  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  23.16 
 
 
785 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.45 
 
 
986 aa  107  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 
805 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.75 
 
 
862 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 
598 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.19 
 
 
804 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 
951 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 
1077 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  20.36 
 
 
590 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
916 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  23.7 
 
 
738 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  24.24 
 
 
577 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.25 
 
 
744 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  26.61 
 
 
1455 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  25.53 
 
 
1108 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  23.59 
 
 
644 aa  101  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.54 
 
 
1026 aa  100  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25.93 
 
 
804 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  21.16 
 
 
598 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  24.55 
 
 
1015 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  22.36 
 
 
1063 aa  98.2  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  24.29 
 
 
596 aa  97.8  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  22.28 
 
 
603 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
806 aa  97.4  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  24.5 
 
 
604 aa  97.1  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  23.39 
 
 
603 aa  97.1  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  22.28 
 
 
603 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  22.11 
 
 
603 aa  96.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  22.11 
 
 
603 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.6 
 
 
858 aa  95.9  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  27.45 
 
 
1046 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  22.11 
 
 
603 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  22.44 
 
 
603 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 
984 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  21.93 
 
 
603 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  22.46 
 
 
599 aa  93.2  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  21.93 
 
 
603 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  23.36 
 
 
601 aa  93.2  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  24.94 
 
 
1129 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  22.37 
 
 
677 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  24.42 
 
 
1076 aa  92  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  22.86 
 
 
827 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  21.84 
 
 
563 aa  92  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  22.54 
 
 
564 aa  91.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  23.58 
 
 
1171 aa  91.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  22.35 
 
 
972 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  23.31 
 
 
588 aa  89.7  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>