More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0134 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 884 aa  1823    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  50.07 
 
 		 799 aa  792    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  51.32 
 
 		 905 aa  943    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  52.4 
 
 		 757 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.85 
 
 		 901 aa  797    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  46.98 
 
 		 800 aa  723    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.32 
 
 		 609 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.7 
 
 		 614 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.81 
 
 		 620 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  41.49 
 
 		 603 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.65 
 
 		 614 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  42.09 
 
 		 640 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.84 
 
 		 623 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  38.2 
 
 		 980 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  40.82 
 
 		 575 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  39.79 
 
 		 864 aa  425  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.95 
 
 		 1064 aa  409  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  40.39 
 
 		 600 aa  404  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  37.52 
 
 		 626 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  38.69 
 
 		 584 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  37.83 
 
 		 602 aa  383  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.02 
 
 		 932 aa  379  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.36 
 
 		 619 aa  371  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  35.48 
 
 		 613 aa  334  4e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.66 
 
 		 590 aa  307  6e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 		 623 aa  294  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.34 
 
 		 640 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.69 
 
 		 614 aa  280  9e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  30.96 
 
 		 593 aa  280  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  31.28 
 
 		 627 aa  278  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.84 
 
 		 614 aa  266  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.55 
 
 		 595 aa  255  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.88 
 
 		 621 aa  255  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 		 645 aa  250  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.68 
 
 		 892 aa  238  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.47 
 
 		 651 aa  223  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  29.07 
 
 		 945 aa  221  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  32.52 
 
 		 889 aa  220  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.99 
 
 		 604 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.04 
 
 		 923 aa  207  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.47 
 
 		 710 aa  203  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  30.54 
 
 		 607 aa  127  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.64 
 
 		 619 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  26.91 
 
 		 596 aa  121  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.36 
 
 		 862 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.51 
 
 		 808 aa  117  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  25.39 
 
 		 599 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  29.75 
 
 		 600 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 598 aa  114  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.13 
 
 		 743 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.87 
 
 		 984 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.1 
 
 		 785 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  26.49 
 
 		 588 aa  109  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 803 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 1084 aa  108  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25.13 
 
 		 1455 aa  108  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  25.28 
 
 		 940 aa  107  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  25.47 
 
 		 1045 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.51 
 
 		 738 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  23.21 
 
 		 644 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  26.06 
 
 		 568 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 		 1175 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.25 
 
 		 929 aa  105  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  26.74 
 
 		 750 aa  104  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.56 
 
 		 858 aa  103  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  25.84 
 
 		 1084 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.78 
 
 		 837 aa  102  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  25.87 
 
 		 964 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 1185 aa  102  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  25.75 
 
 		 590 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.27 
 
 		 1053 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  25.34 
 
 		 1024 aa  101  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.64 
 
 		 1033 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.86 
 
 		 598 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 		 925 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.35 
 
 		 824 aa  99  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  23.15 
 
 		 601 aa  98.6  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25 
 
 		 1171 aa  99  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  23 
 
 		 1063 aa  98.2  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 888 aa  98.2  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  25.4 
 
 		 972 aa  97.8  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  23.32 
 
 		 1008 aa  97.8  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.42 
 
 		 717 aa  97.8  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  24.7 
 
 		 577 aa  97.4  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  24.41 
 
 		 686 aa  97.8  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  26.45 
 
 		 603 aa  97.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.14 
 
 		 1424 aa  96.3  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.9 
 
 		 804 aa  96.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  24.75 
 
 		 563 aa  95.9  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.56 
 
 		 804 aa  95.5  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.03 
 
 		 1005 aa  95.5  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  22.85 
 
 		 1030 aa  95.1  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.85 
 
 		 1030 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.3 
 
 		 744 aa  95.1  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  23.92 
 
 		 815 aa  94.7  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  22.85 
 
 		 1030 aa  94.4  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  25 
 
 		 597 aa  94.4  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  22.45 
 
 		 1030 aa  93.6  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  25 
 
 		 837 aa  94  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3212  hypothetical protein  32.11 
 
 		 198 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>