294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0084 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  54.26 
 
 
603 aa  678    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  59.87 
 
 
614 aa  762    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  62.11 
 
 
620 aa  787    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 
614 aa  1262    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.02 
 
 
901 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  46.46 
 
 
757 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  44.91 
 
 
905 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.53 
 
 
799 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  45.61 
 
 
640 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.84 
 
 
884 aa  512  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.63 
 
 
800 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.17 
 
 
609 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  42.76 
 
 
864 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  44.95 
 
 
575 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  44.24 
 
 
623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  42.61 
 
 
980 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  42.32 
 
 
600 aa  422  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.14 
 
 
932 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  42.15 
 
 
584 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
626 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  41.48 
 
 
602 aa  401  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.97 
 
 
1064 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.1 
 
 
619 aa  375  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  36.26 
 
 
613 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 
623 aa  288  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.68 
 
 
640 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  34.27 
 
 
627 aa  278  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.71 
 
 
614 aa  277  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.14 
 
 
595 aa  272  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.76 
 
 
590 aa  267  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 
593 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34 
 
 
614 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.9 
 
 
621 aa  249  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0165303 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 
645 aa  238  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.3 
 
 
604 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.87 
 
 
651 aa  233  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.01 
 
 
892 aa  216  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.84 
 
 
710 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 
945 aa  193  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  32.21 
 
 
889 aa  191  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.04 
 
 
923 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.44 
 
 
619 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.63 
 
 
743 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  30.82 
 
 
940 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.73 
 
 
929 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  22.54 
 
 
925 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.12 
 
 
858 aa  107  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.41 
 
 
986 aa  107  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.06 
 
 
862 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.06 
 
 
805 aa  105  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  27.95 
 
 
824 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 
803 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
916 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.9 
 
 
717 aa  98.2  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  26.39 
 
 
1355 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.86 
 
 
750 aa  97.8  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  25.98 
 
 
815 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 
932 aa  95.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.88 
 
 
811 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  22.66 
 
 
766 aa  94  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  22.27 
 
 
984 aa  93.6  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  24.39 
 
 
1015 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  23.47 
 
 
951 aa  91.3  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.58 
 
 
804 aa  90.9  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.35 
 
 
837 aa  90.9  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  24.52 
 
 
686 aa  90.9  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 
832 aa  90.9  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  26.11 
 
 
964 aa  90.9  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.15 
 
 
787 aa  89.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 
734 aa  89  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.9 
 
 
804 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  23.33 
 
 
1076 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 
806 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25.3 
 
 
1171 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  24.22 
 
 
972 aa  88.2  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  25.44 
 
 
607 aa  87.8  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  24.14 
 
 
1084 aa  87.4  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  24.15 
 
 
738 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  23.97 
 
 
587 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  21.57 
 
 
1455 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  22.86 
 
 
928 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  23.45 
 
 
1084 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 
914 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25.06 
 
 
1175 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  22.98 
 
 
848 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.97 
 
 
808 aa  85.1  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  26.47 
 
 
1036 aa  84.7  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  23.46 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  25.93 
 
 
1008 aa  84.7  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 
806 aa  84.7  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.92 
 
 
1005 aa  84.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 
825 aa  84  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.42 
 
 
794 aa  84  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  22.27 
 
 
596 aa  83.2  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  24.94 
 
 
1035 aa  83.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.66 
 
 
1033 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.75 
 
 
805 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  24.68 
 
 
1045 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  24.63 
 
 
1108 aa  81.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  23.06 
 
 
563 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>