More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4492 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  100 
 
 		 889 aa  1774    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.97 
 
 		 892 aa  551  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.59 
 
 		 923 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.11 
 
 		 590 aa  259  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 		 627 aa  249  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 		 645 aa  239  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 		 945 aa  240  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.98 
 
 		 640 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.99 
 
 		 905 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.28 
 
 		 595 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.2 
 
 		 799 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 		 623 aa  221  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.52 
 
 		 884 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  32.05 
 
 		 593 aa  218  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.79 
 
 		 623 aa  207  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.23 
 
 		 901 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.05 
 
 		 932 aa  203  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.7 
 
 		 609 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.24 
 
 		 640 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.32 
 
 		 620 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.03 
 
 		 614 aa  197  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 		 603 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.15 
 
 		 604 aa  194  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.24 
 
 		 1064 aa  193  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.73 
 
 		 614 aa  193  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.82 
 
 		 757 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.84 
 
 		 710 aa  192  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.8 
 
 		 800 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.56 
 
 		 864 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  32.08 
 
 		 600 aa  192  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.21 
 
 		 614 aa  191  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.88 
 
 		 575 aa  190  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.41 
 
 		 614 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.55 
 
 		 619 aa  187  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.55 
 
 		 602 aa  186  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 		 626 aa  185  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.21 
 
 		 619 aa  184  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.5 
 
 		 651 aa  184  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  30.45 
 
 		 613 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  30.33 
 
 		 686 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  30.55 
 
 		 603 aa  177  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.43 
 
 		 980 aa  177  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  34.27 
 
 		 584 aa  177  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.17 
 
 		 621 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.64 
 
 		 738 aa  168  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.51 
 
 		 607 aa  168  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.55 
 
 		 929 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  30.45 
 
 		 587 aa  164  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.86 
 
 		 600 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  28.87 
 
 		 597 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 803 aa  156  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.6 
 
 		 598 aa  156  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  29.94 
 
 		 590 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  30.05 
 
 		 972 aa  153  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  25.76 
 
 		 591 aa  152  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  31.06 
 
 		 604 aa  151  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  30.91 
 
 		 568 aa  149  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  31.79 
 
 		 743 aa  146  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  27.42 
 
 		 625 aa  144  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  27.79 
 
 		 596 aa  143  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  32.02 
 
 		 804 aa  140  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.58 
 
 		 1424 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 1175 aa  137  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 		 598 aa  137  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  26.87 
 
 		 603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  30.17 
 
 		 1063 aa  135  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  28.27 
 
 		 1036 aa  135  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  28.44 
 
 		 1129 aa  134  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  30.99 
 
 		 804 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  28.15 
 
 		 603 aa  131  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  26.36 
 
 		 603 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  26.36 
 
 		 603 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  26.36 
 
 		 603 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 		 932 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  29.87 
 
 		 1355 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  25.41 
 
 		 599 aa  129  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  28.86 
 
 		 862 aa  129  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  26.36 
 
 		 603 aa  129  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.4 
 
 		 1033 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  30.2 
 
 		 750 aa  128  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  26.94 
 
 		 677 aa  127  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.55 
 
 		 1264 aa  127  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  26.12 
 
 		 603 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  30.09 
 
 		 1041 aa  127  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 1043 aa  127  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  25.18 
 
 		 848 aa  126  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25 
 
 		 1455 aa  126  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  28.65 
 
 		 588 aa  126  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  30.68 
 
 		 1028 aa  126  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  28.85 
 
 		 1108 aa  126  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  29.31 
 
 		 1032 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  26.39 
 
 		 603 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  27.76 
 
 		 1024 aa  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  26.39 
 
 		 603 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.41 
 
 		 787 aa  125  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  29.22 
 
 		 1029 aa  125  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  27.7 
 
 		 1076 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  27.71 
 
 		 563 aa  124  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.72 
 
 		 1026 aa  124  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  24.24 
 
 		 601 aa  124  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>