More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0579 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  100 
 
 		 597 aa  1234    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  55.9 
 
 		 604 aa  666    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  51.71 
 
 		 598 aa  633  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  48.15 
 
 		 600 aa  630  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  47.89 
 
 		 607 aa  587  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  48.05 
 
 		 625 aa  573  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  40.29 
 
 		 591 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  40.03 
 
 		 587 aa  415  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  39.76 
 
 		 568 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  37.99 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  31.4 
 
 		 563 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  32.25 
 
 		 564 aa  234  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  29.48 
 
 		 670 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  25.82 
 
 		 603 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.59 
 
 		 598 aa  194  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  25.65 
 
 		 603 aa  193  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  25.65 
 
 		 603 aa  193  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  28.42 
 
 		 558 aa  193  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  25.65 
 
 		 603 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  25.65 
 
 		 603 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  25.49 
 
 		 603 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  25.49 
 
 		 603 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  25.33 
 
 		 603 aa  189  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  30.17 
 
 		 738 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  27.2 
 
 		 577 aa  189  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  27.42 
 
 		 590 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.96 
 
 		 862 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  27.18 
 
 		 824 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  26.06 
 
 		 603 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 		 803 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  26.62 
 
 		 601 aa  176  9e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.6 
 
 		 644 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  28 
 
 		 848 aa  170  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  26.11 
 
 		 588 aa  169  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  29.24 
 
 		 897 aa  169  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  28.09 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  25.12 
 
 		 599 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 		 888 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  28.45 
 
 		 686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  29.02 
 
 		 707 aa  163  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  24.55 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.63 
 
 		 923 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.75 
 
 		 743 aa  156  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  28.87 
 
 		 889 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.1 
 
 		 892 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  29.13 
 
 		 750 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  30.99 
 
 		 972 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  25.08 
 
 		 598 aa  153  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  28.39 
 
 		 677 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.22 
 
 		 741 aa  150  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  28.06 
 
 		 704 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.72 
 
 		 748 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  27.61 
 
 		 717 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.72 
 
 		 747 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.85 
 
 		 804 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  27.23 
 
 		 804 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  27.86 
 
 		 754 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  28.75 
 
 		 964 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  25.3 
 
 		 894 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  28.44 
 
 		 815 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.22 
 
 		 1004 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  29.51 
 
 		 785 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  27.9 
 
 		 1003 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.24 
 
 		 1018 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  29.38 
 
 		 859 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  26.27 
 
 		 806 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  27.7 
 
 		 1020 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.84 
 
 		 968 aa  117  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  26.39 
 
 		 1171 aa  117  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  28.07 
 
 		 763 aa  117  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  25.19 
 
 		 1355 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.85 
 
 		 858 aa  114  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 		 1084 aa  114  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.01 
 
 		 1041 aa  113  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  29.45 
 
 		 600 aa  113  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  26.16 
 
 		 1084 aa  113  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25.29 
 
 		 1129 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.07 
 
 		 602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 781 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.67 
 
 		 1026 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.04 
 
 		 590 aa  110  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.07 
 
 		 781 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.65 
 
 		 805 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.43 
 
 		 929 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.87 
 
 		 992 aa  109  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  25.88 
 
 		 1046 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.76 
 
 		 811 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.25 
 
 		 794 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.59 
 
 		 922 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  27.14 
 
 		 1008 aa  107  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.94 
 
 		 1013 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 951 aa  107  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.71 
 
 		 623 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 766 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.87 
 
 		 575 aa  105  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25.5 
 
 		 1035 aa  105  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  22.94 
 
 		 1175 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.43 
 
 		 1003 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 806 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  26.56 
 
 		 1059 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>