292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1730 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 600 aa  1246    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  50 
 
 		 584 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  46.54 
 
 		 932 aa  537  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  45.33 
 
 		 626 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  42.86 
 
 		 602 aa  449  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  39.52 
 
 		 640 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.32 
 
 		 614 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.57 
 
 		 619 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.99 
 
 		 620 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.93 
 
 		 614 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.46 
 
 		 800 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.39 
 
 		 884 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.8 
 
 		 799 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.19 
 
 		 901 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  38.27 
 
 		 603 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.75 
 
 		 757 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.48 
 
 		 905 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.13 
 
 		 609 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  36.73 
 
 		 980 aa  359  7e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  35.99 
 
 		 575 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  37.44 
 
 		 864 aa  354  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.86 
 
 		 1064 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.56 
 
 		 623 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  34.04 
 
 		 613 aa  309  9e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 		 593 aa  252  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.13 
 
 		 640 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.29 
 
 		 590 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.15 
 
 		 595 aa  244  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.27 
 
 		 614 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 627 aa  233  9e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.54 
 
 		 621 aa  220  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  30.16 
 
 		 623 aa  216  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.5 
 
 		 614 aa  213  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.25 
 
 		 604 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  32.08 
 
 		 889 aa  192  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.48 
 
 		 651 aa  191  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.78 
 
 		 892 aa  187  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  26.94 
 
 		 645 aa  180  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.36 
 
 		 923 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.15 
 
 		 710 aa  166  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 945 aa  161  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  29.45 
 
 		 597 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  30.99 
 
 		 686 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.21 
 
 		 972 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.47 
 
 		 607 aa  107  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.02 
 
 		 738 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  24.79 
 
 		 824 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  30.47 
 
 		 587 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.95 
 
 		 744 aa  98.6  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  25 
 
 		 1045 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 		 803 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.65 
 
 		 929 aa  95.1  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.97 
 
 		 600 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  27 
 
 		 743 aa  94  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.19 
 
 		 619 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  23.06 
 
 		 1084 aa  90.5  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  26.61 
 
 		 964 aa  90.1  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.58 
 
 		 815 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 1084 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.59 
 
 		 794 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  26.71 
 
 		 940 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.45 
 
 		 808 aa  85.1  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 916 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 598 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  27.83 
 
 		 604 aa  84  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  25.21 
 
 		 1019 aa  83.6  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.51 
 
 		 598 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.8 
 
 		 858 aa  82.4  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.28 
 
 		 1018 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  25.09 
 
 		 603 aa  81.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  25.51 
 
 		 625 aa  81.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  27.3 
 
 		 859 aa  80.5  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  24.44 
 
 		 568 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.98 
 
 		 1781 aa  79.7  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.9 
 
 		 837 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  23.21 
 
 		 1455 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  25.34 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 951 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3896  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.62 
 
 		 951 aa  79  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0623338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25 
 
 		 1036 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.97 
 
 		 811 aa  77.4  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  25.84 
 
 		 1355 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.07 
 
 		 805 aa  77.4  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  24.11 
 
 		 862 aa  77.4  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 		 925 aa  77  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 		 766 aa  77  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 807 aa  77  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.05 
 
 		 1013 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  24.21 
 
 		 1041 aa  75.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 806 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  23.28 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 914 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 827 aa  74.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.01 
 
 		 717 aa  74.3  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  25.31 
 
 		 848 aa  74.3  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  23.9 
 
 		 785 aa  73.9  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  22.89 
 
 		 1023 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.68 
 
 		 878 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  23.28 
 
 		 596 aa  73.6  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.45 
 
 		 824 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>