257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3244 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  84.21 
 
 		 914 aa  1571    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 916 aa  1855    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.03 
 
 		 923 aa  162  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.05 
 
 		 929 aa  145  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  27.41 
 
 		 889 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.61 
 
 		 892 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.48 
 
 		 980 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.15 
 
 		 614 aa  104  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25 
 
 		 590 aa  103  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  27.91 
 
 		 603 aa  101  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  25.52 
 
 		 707 aa  101  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 603 aa  100  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3865  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.58 
 
 		 918 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.160045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.27 
 
 		 614 aa  99.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 		 623 aa  98.6  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.01 
 
 		 905 aa  99  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  26.82 
 
 		 564 aa  98.6  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.24 
 
 		 563 aa  97.4  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.86 
 
 		 799 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.56 
 
 		 757 aa  94.7  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  24.64 
 
 		 738 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.75 
 
 		 602 aa  94.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.74 
 
 		 620 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.84 
 
 		 609 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.27 
 
 		 800 aa  92.8  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.5 
 
 		 640 aa  92  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.7 
 
 		 575 aa  91.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  21.78 
 
 		 601 aa  91.3  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  23.53 
 
 		 613 aa  90.9  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  25.72 
 
 		 972 aa  90.5  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  24.64 
 
 		 686 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.28 
 
 		 901 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  23.38 
 
 		 591 aa  89.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.5 
 
 		 824 aa  87.8  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.25 
 
 		 932 aa  87.8  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 		 627 aa  87  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.45 
 
 		 864 aa  87.4  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  24.88 
 
 		 558 aa  86.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.4 
 
 		 595 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.5 
 
 		 1064 aa  85.5  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  23.26 
 
 		 645 aa  85.1  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.27 
 
 		 1018 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  25.73 
 
 		 600 aa  85.1  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.44 
 
 		 640 aa  84.7  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  22.62 
 
 		 897 aa  84.7  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  24.15 
 
 		 813 aa  83.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3896  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.98 
 
 		 951 aa  83.2  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0623338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.53 
 
 		 884 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  23.39 
 
 		 597 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.8 
 
 		 619 aa  81.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.48 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  24.26 
 
 		 1171 aa  81.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.98 
 
 		 587 aa  81.6  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.52 
 
 		 623 aa  81.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.46 
 
 		 604 aa  80.9  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.43 
 
 		 619 aa  80.9  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.56 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  22.96 
 
 		 607 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.27 
 
 		 805 aa  80.9  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  23.89 
 
 		 862 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.4 
 
 		 913 aa  80.1  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.92 
 
 		 614 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.09 
 
 		 621 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  23.79 
 
 		 1084 aa  79.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  22.51 
 
 		 743 aa  79  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  26.7 
 
 		 568 aa  78.2  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 		 987 aa  78.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  23.79 
 
 		 1084 aa  78.2  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  22.98 
 
 		 704 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  24.29 
 
 		 1043 aa  77.8  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  25.23 
 
 		 964 aa  77.4  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  22.48 
 
 		 1035 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  26.44 
 
 		 584 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.31 
 
 		 920 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.53 
 
 		 920 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.18 
 
 		 858 aa  76.6  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  25.58 
 
 		 604 aa  76.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  21.17 
 
 		 848 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  20.49 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 832 aa  75.1  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.23 
 
 		 717 aa  75.1  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 		 724 aa  75.1  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  22.07 
 
 		 806 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  23.24 
 
 		 894 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.82 
 
 		 1088 aa  73.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.51 
 
 		 744 aa  73.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  24.5 
 
 		 625 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.18 
 
 		 811 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  21.85 
 
 		 1045 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  22.46 
 
 		 766 aa  72.4  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.47 
 
 		 651 aa  72  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  21.74 
 
 		 984 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  21.08 
 
 		 1175 aa  72.4  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  23.67 
 
 		 1020 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  24.72 
 
 		 992 aa  72.4  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  25.54 
 
 		 859 aa  71.6  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.66 
 
 		 824 aa  71.2  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  22.7 
 
 		 750 aa  70.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  23.79 
 
 		 888 aa  70.1  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>