More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2024 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  54.88 
 
 		 614 aa  671    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 603 aa  1240    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  57.78 
 
 		 614 aa  707    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  56.85 
 
 		 620 aa  683    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.75 
 
 		 799 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  43.99 
 
 		 640 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.58 
 
 		 757 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.77 
 
 		 609 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.04 
 
 		 905 aa  502  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.62 
 
 		 901 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  44.44 
 
 		 800 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.49 
 
 		 884 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  41.12 
 
 		 864 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.67 
 
 		 623 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  39.97 
 
 		 980 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  38.88 
 
 		 626 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  39.86 
 
 		 575 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  40.07 
 
 		 584 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.92 
 
 		 1064 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  38.27 
 
 		 600 aa  395  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.03 
 
 		 619 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.99 
 
 		 932 aa  392  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  39.06 
 
 		 602 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  36.26 
 
 		 613 aa  376  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.9 
 
 		 590 aa  311  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 593 aa  302  9e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.34 
 
 		 640 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 		 623 aa  289  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.72 
 
 		 595 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.8 
 
 		 614 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 		 627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.45 
 
 		 614 aa  253  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  31.32 
 
 		 645 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.84 
 
 		 651 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.85 
 
 		 604 aa  243  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.58 
 
 		 621 aa  233  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.05 
 
 		 892 aa  223  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 945 aa  211  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.43 
 
 		 710 aa  200  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  30.81 
 
 		 889 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.12 
 
 		 923 aa  177  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.05 
 
 		 743 aa  120  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.9 
 
 		 619 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  28.89 
 
 		 804 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.2 
 
 		 858 aa  110  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  26.02 
 
 		 815 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.43 
 
 		 750 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.16 
 
 		 811 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  28.64 
 
 		 804 aa  107  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  22.82 
 
 		 928 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.65 
 
 		 794 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  24.8 
 
 		 862 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  27.25 
 
 		 1019 aa  104  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  25.08 
 
 		 940 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.58 
 
 		 929 aa  102  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  23.82 
 
 		 925 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 916 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  23.78 
 
 		 601 aa  100  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 		 803 aa  100  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.3 
 
 		 986 aa  100  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.61 
 
 		 1033 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  26.73 
 
 		 1171 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 		 806 aa  97.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 		 766 aa  97.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  25.89 
 
 		 607 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  26.73 
 
 		 588 aa  96.3  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  22.14 
 
 		 1015 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  25.41 
 
 		 1355 aa  95.5  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 951 aa  94  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 		 932 aa  94  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 		 984 aa  93.6  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 914 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  25.27 
 
 		 1045 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 734 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  23.88 
 
 		 1076 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.74 
 
 		 805 aa  92.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 1077 aa  92  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.08 
 
 		 824 aa  91.3  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  24.63 
 
 		 686 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.36 
 
 		 837 aa  90.9  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  26.97 
 
 		 763 aa  90.1  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.73 
 
 		 1781 aa  89.7  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  22.72 
 
 		 1024 aa  90.1  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.53 
 
 		 1329 aa  89  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  23.04 
 
 		 785 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  21.51 
 
 		 598 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 		 781 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  23.77 
 
 		 577 aa  88.2  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.29 
 
 		 563 aa  88.2  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.07 
 
 		 808 aa  87.8  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  21.58 
 
 		 590 aa  87.4  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.06 
 
 		 781 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.4 
 
 		 738 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.19 
 
 		 1013 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  22.94 
 
 		 587 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  25.66 
 
 		 1046 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 1175 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  22.47 
 
 		 1035 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  23.46 
 
 		 1023 aa  85.5  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.44 
 
 		 813 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>