282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4208 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  100 
 
 
587 aa  1197    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  57.75 
 
 
568 aa  674    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  38.01 
 
 
598 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  38.36 
 
 
600 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  39.42 
 
 
607 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  40.03 
 
 
597 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  40.99 
 
 
604 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  39.63 
 
 
625 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  37.41 
 
 
591 aa  382  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  37.76 
 
 
603 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  29.37 
 
 
897 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  28.77 
 
 
588 aa  208  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  29.82 
 
 
603 aa  206  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  29.47 
 
 
603 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  28.45 
 
 
738 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  29.47 
 
 
603 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  30.22 
 
 
670 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  29.62 
 
 
603 aa  201  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  29.62 
 
 
603 aa  200  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  27.34 
 
 
599 aa  200  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  29.47 
 
 
603 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.92 
 
 
598 aa  198  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.96 
 
 
563 aa  198  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  27.39 
 
 
564 aa  197  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  28.34 
 
 
596 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  29.12 
 
 
603 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  29.12 
 
 
603 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  28.92 
 
 
558 aa  192  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  28.14 
 
 
603 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  25.71 
 
 
601 aa  189  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  27.32 
 
 
824 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.73 
 
 
707 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  29.61 
 
 
686 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  28.44 
 
 
677 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  27.04 
 
 
577 aa  182  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  28.85 
 
 
590 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  29.64 
 
 
704 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  24.82 
 
 
803 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.42 
 
 
644 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  28.45 
 
 
888 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  34.81 
 
 
972 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  29.59 
 
 
512 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  30.45 
 
 
889 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.34 
 
 
747 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.83 
 
 
748 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  26.41 
 
 
598 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.53 
 
 
862 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  27.18 
 
 
717 aa  157  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.74 
 
 
923 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.81 
 
 
804 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  23.39 
 
 
848 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  31.77 
 
 
743 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  28.51 
 
 
750 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.01 
 
 
741 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.61 
 
 
804 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.42 
 
 
805 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  24.91 
 
 
928 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  30.68 
 
 
785 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 
827 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
754 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  26.26 
 
 
1175 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.52 
 
 
986 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  24.96 
 
 
806 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.01 
 
 
892 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.55 
 
 
1041 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  28.64 
 
 
815 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.58 
 
 
1033 aa  135  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  30.73 
 
 
763 aa  134  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  30.53 
 
 
1063 aa  134  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  27.89 
 
 
1036 aa  133  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.13 
 
 
805 aa  133  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  26.73 
 
 
1171 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.56 
 
 
1013 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  28.34 
 
 
1008 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  27.08 
 
 
1108 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.35 
 
 
858 aa  130  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.13 
 
 
1093 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.49 
 
 
811 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25.59 
 
 
1129 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  22.77 
 
 
1015 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  26.45 
 
 
1023 aa  127  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
858 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 
919 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  24.78 
 
 
1084 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 
766 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
1084 aa  124  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  26.71 
 
 
1355 aa  124  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.47 
 
 
1030 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 
1079 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  28.89 
 
 
1023 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 
925 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 
640 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  27.25 
 
 
1041 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  25.93 
 
 
859 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  27.6 
 
 
1026 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 
832 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  25.18 
 
 
894 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.02 
 
 
787 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.64 
 
 
781 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  29.36 
 
 
781 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>