272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3255 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  54.23 
 
 		 603 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  54.39 
 
 		 603 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  100 
 
 		 598 aa  1216    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  54.23 
 
 		 603 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  67.34 
 
 		 590 aa  816    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  54.74 
 
 		 603 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  53.9 
 
 		 603 aa  658    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  54.23 
 
 		 603 aa  662    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  54.06 
 
 		 603 aa  662    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  54.06 
 
 		 603 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  54.39 
 
 		 603 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  53.64 
 
 		 644 aa  630  1e-179  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  43.81 
 
 		 601 aa  546  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  44.09 
 
 		 577 aa  510  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  43.7 
 
 		 598 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  44.17 
 
 		 588 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  43.14 
 
 		 596 aa  480  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  41.58 
 
 		 599 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  47.56 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  37.27 
 
 		 564 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  37.19 
 
 		 563 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  34.63 
 
 		 558 aa  312  1e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0829  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  52.54 
 
 		 188 aa  191  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.59 
 
 		 738 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  28.55 
 
 		 686 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.04 
 
 		 607 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  28.55 
 
 		 568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  24.72 
 
 		 600 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 888 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  28.59 
 
 		 604 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  27.99 
 
 		 743 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 		 598 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.5 
 
 		 707 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.41 
 
 		 587 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  27.32 
 
 		 677 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  27.46 
 
 		 717 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  24.88 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  27.38 
 
 		 897 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  26.53 
 
 		 603 aa  156  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  24.46 
 
 		 928 aa  153  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.11 
 
 		 781 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.33 
 
 		 614 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.76 
 
 		 1019 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 		 781 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  27.71 
 
 		 704 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.76 
 
 		 894 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.74 
 
 		 625 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.14 
 
 		 1033 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  24.44 
 
 		 591 aa  147  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.55 
 
 		 972 aa  146  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.84 
 
 		 858 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.5 
 
 		 986 aa  144  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  23.52 
 
 		 862 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  28.41 
 
 		 754 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  27.68 
 
 		 670 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 		 832 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 1084 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 1043 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 		 984 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.7 
 
 		 651 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  27.15 
 
 		 1084 aa  137  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  24.21 
 
 		 1015 aa  137  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  28.22 
 
 		 815 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 803 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.71 
 
 		 747 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.52 
 
 		 748 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 873 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.54 
 
 		 750 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.13 
 
 		 614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.51 
 
 		 992 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  26.67 
 
 		 1076 aa  132  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.67 
 
 		 913 aa  130  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  27.98 
 
 		 889 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.32 
 
 		 621 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  28.22 
 
 		 919 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  29.15 
 
 		 1003 aa  128  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  24.4 
 
 		 1046 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.16 
 
 		 903 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  28.31 
 
 		 1023 aa  127  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 1077 aa  127  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 		 623 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  23.12 
 
 		 1024 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  24.27 
 
 		 1455 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2089  Beta-glucuronidase  49.12 
 
 		 132 aa  125  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  24.69 
 
 		 1059 aa  124  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.15 
 
 		 1781 aa  124  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.85 
 
 		 1424 aa  123  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  24.6 
 
 		 785 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  23.42 
 
 		 1035 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 640 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.24 
 
 		 1030 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  27.27 
 
 		 1028 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  25.98 
 
 		 1045 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 		 766 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.02 
 
 		 1041 aa  122  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.04 
 
 		 922 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.44 
 
 		 805 aa  120  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.43 
 
 		 968 aa  121  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  29.02 
 
 		 1063 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 		 806 aa  120  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>