278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3487 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  42.38 
 
 		 804 aa  655    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  42.63 
 
 		 804 aa  656    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  100 
 
 		 748 aa  1547    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  74.33 
 
 		 754 aa  1191    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  94.65 
 
 		 747 aa  1475    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  44.81 
 
 		 741 aa  660    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  40.34 
 
 		 750 aa  522  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  40.18 
 
 		 743 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 		 766 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  33.03 
 
 		 803 aa  200  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  32.92 
 
 		 785 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.91 
 
 		 913 aa  190  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25.42 
 
 		 763 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.97 
 
 		 805 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 979 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 		 832 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  28.39 
 
 		 862 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 		 781 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.75 
 
 		 781 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.33 
 
 		 858 aa  172  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 925 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  28.03 
 
 		 563 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  25.58 
 
 		 928 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  24.8 
 
 		 1015 aa  165  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  27.14 
 
 		 564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 827 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 984 aa  160  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  27.31 
 
 		 587 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.03 
 
 		 808 aa  158  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  27.59 
 
 		 568 aa  158  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.62 
 
 		 805 aa  157  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  28.7 
 
 		 824 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.37 
 
 		 1781 aa  155  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 919 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  26.1 
 
 		 932 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.22 
 
 		 986 aa  155  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  27.63 
 
 		 894 aa  154  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  35.24 
 
 		 1084 aa  151  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 806 aa  151  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.93 
 
 		 837 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  25.8 
 
 		 891 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.68 
 
 		 738 aa  147  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  27.72 
 
 		 597 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.96 
 
 		 903 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  33.79 
 
 		 1084 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.33 
 
 		 811 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  27.76 
 
 		 1045 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.83 
 
 		 794 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  29.7 
 
 		 1019 aa  140  7.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  28.15 
 
 		 590 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  24.31 
 
 		 873 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  31.44 
 
 		 1020 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  29.03 
 
 		 848 aa  140  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  25.9 
 
 		 600 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  24.71 
 
 		 1046 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  30.56 
 
 		 1043 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  29.02 
 
 		 686 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  23.85 
 
 		 1355 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.75 
 
 		 707 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.77 
 
 		 787 aa  135  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  27.62 
 
 		 558 aa  134  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  31.83 
 
 		 987 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.12 
 
 		 923 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  31.07 
 
 		 972 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 		 888 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 		 598 aa  132  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  29.75 
 
 		 1129 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  26.24 
 
 		 1035 aa  131  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  28.01 
 
 		 1108 aa  131  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  23.46 
 
 		 961 aa  130  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.63 
 
 		 625 aa  130  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  28.01 
 
 		 704 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 951 aa  130  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  29.21 
 
 		 1112 aa  130  9.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  27.3 
 
 		 1059 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 		 825 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  28.05 
 
 		 604 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  28.89 
 
 		 1063 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.97 
 
 		 1026 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.32 
 
 		 922 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  29.83 
 
 		 1049 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.74 
 
 		 1289 aa  127  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  30.84 
 
 		 859 aa  127  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  27.39 
 
 		 598 aa  127  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 1094 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.99 
 
 		 598 aa  127  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  24.94 
 
 		 603 aa  126  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  24.94 
 
 		 603 aa  126  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  27.08 
 
 		 1455 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.51 
 
 		 1264 aa  125  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.53 
 
 		 813 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  25.39 
 
 		 603 aa  124  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  24.72 
 
 		 603 aa  124  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  29.64 
 
 		 1023 aa  124  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  24.72 
 
 		 603 aa  124  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  25.21 
 
 		 815 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  29.31 
 
 		 1044 aa  124  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.48 
 
 		 920 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  24.5 
 
 		 603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  30.57 
 
 		 603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>