289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1810 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  41.89 
 
 		 811 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 794 aa  1657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  42.59 
 
 		 815 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.03 
 
 		 837 aa  558  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.15 
 
 		 808 aa  549  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  38.62 
 
 		 1015 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  34.91 
 
 		 799 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.64 
 
 		 805 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  34.01 
 
 		 825 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  38.33 
 
 		 928 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  37.71 
 
 		 829 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  35.11 
 
 		 827 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  35.57 
 
 		 873 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 806 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.32 
 
 		 813 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.09 
 
 		 986 aa  479  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  34.99 
 
 		 919 aa  478  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  34.71 
 
 		 1355 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 832 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.86 
 
 		 824 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.62 
 
 		 787 aa  437  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.46 
 
 		 903 aa  438  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  31.97 
 
 		 891 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 932 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  31.22 
 
 		 858 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 807 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.7 
 
 		 1781 aa  402  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  31.49 
 
 		 806 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 		 984 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  30.6 
 
 		 859 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 		 925 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.71 
 
 		 805 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  29.8 
 
 		 961 aa  353  8e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  30.04 
 
 		 964 aa  347  7e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 1185 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.24 
 
 		 1093 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 655 aa  323  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  37.53 
 
 		 922 aa  317  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  33.12 
 
 		 604 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.89 
 
 		 882 aa  311  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.07 
 
 		 750 aa  248  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.02 
 
 		 858 aa  222  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.22 
 
 		 743 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.03 
 
 		 862 aa  197  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  23.77 
 
 		 781 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  24.25 
 
 		 979 aa  187  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.54 
 
 		 781 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  30.4 
 
 		 894 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.3 
 
 		 707 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.08 
 
 		 704 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 		 888 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  25.43 
 
 		 897 aa  166  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 		 803 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 1175 aa  160  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  41.9 
 
 		 309 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.7 
 
 		 824 aa  156  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 766 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.39 
 
 		 738 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  22.53 
 
 		 763 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.37 
 
 		 1129 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  24.97 
 
 		 754 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  28 
 
 		 785 aa  148  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  30.4 
 
 		 1019 aa  146  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.42 
 
 		 920 aa  146  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  28.36 
 
 		 1171 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  30.21 
 
 		 686 aa  145  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.13 
 
 		 748 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.81 
 
 		 747 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.23 
 
 		 972 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  22.87 
 
 		 848 aa  134  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  25.09 
 
 		 804 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.24 
 
 		 920 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.71 
 
 		 913 aa  133  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  26.3 
 
 		 1020 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  27.38 
 
 		 1044 aa  131  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.11 
 
 		 607 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.47 
 
 		 1289 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.84 
 
 		 717 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  27.12 
 
 		 1024 aa  128  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  26.7 
 
 		 1035 aa  129  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25.64 
 
 		 804 aa  127  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.87 
 
 		 1264 aa  126  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.82 
 
 		 1424 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.49 
 
 		 1018 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  26.41 
 
 		 1059 aa  124  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 1077 aa  124  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 987 aa  124  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  26.77 
 
 		 1076 aa  124  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  25.64 
 
 		 600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 		 951 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  25.58 
 
 		 1043 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.54 
 
 		 1026 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  25.84 
 
 		 1017 aa  122  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  25.21 
 
 		 670 aa  122  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  28.25 
 
 		 1108 aa  121  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  27.23 
 
 		 1035 aa  121  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  26.71 
 
 		 564 aa  120  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.83 
 
 		 1041 aa  120  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.48 
 
 		 1033 aa  120  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  25.24 
 
 		 1045 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>