More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2038 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  37.84 
 
 
1112 aa  733    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  37.26 
 
 
1049 aa  688    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 
1094 aa  681    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  50.66 
 
 
1045 aa  1068    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 
1079 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  38 
 
 
1045 aa  726    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  39.73 
 
 
1455 aa  721    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  37.37 
 
 
1076 aa  683    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  40.96 
 
 
1084 aa  767    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  100 
 
 
1046 aa  2157    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  39.89 
 
 
1043 aa  762    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  40.35 
 
 
1084 aa  763    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  39.09 
 
 
1077 aa  745    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  37.73 
 
 
1059 aa  751    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  42.16 
 
 
1035 aa  813    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  36.06 
 
 
1019 aa  644    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  36.96 
 
 
1129 aa  629  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.46 
 
 
1033 aa  625  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  35.74 
 
 
1035 aa  624  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  33.83 
 
 
1063 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.15 
 
 
1026 aa  605  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  35.47 
 
 
1108 aa  597  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  33.9 
 
 
1041 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.64 
 
 
1033 aa  582  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  34.03 
 
 
1044 aa  579  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  33.49 
 
 
1024 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.52 
 
 
1013 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  33.58 
 
 
1024 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.58 
 
 
1024 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  33.58 
 
 
1024 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  32.51 
 
 
1028 aa  564  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  33.61 
 
 
1024 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  33.71 
 
 
1024 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  33.56 
 
 
1029 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  32.85 
 
 
1066 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  33.58 
 
 
1024 aa  562  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  32.85 
 
 
1066 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  33.58 
 
 
1024 aa  559  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  33.18 
 
 
1050 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  32.7 
 
 
1032 aa  551  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  32.29 
 
 
1043 aa  546  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  31.88 
 
 
1043 aa  548  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  32.7 
 
 
1164 aa  545  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  32.25 
 
 
1012 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.82 
 
 
1264 aa  542  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  31.89 
 
 
1043 aa  539  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  32.4 
 
 
1020 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.28 
 
 
1005 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.08 
 
 
1053 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  32.32 
 
 
1036 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.17 
 
 
1041 aa  528  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  34.18 
 
 
1026 aa  525  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.31 
 
 
1036 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  33.18 
 
 
1024 aa  521  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  33.77 
 
 
1031 aa  521  1e-146  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  33.83 
 
 
1036 aa  521  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  31.59 
 
 
1008 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  30.88 
 
 
1030 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  30.98 
 
 
1030 aa  506  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.98 
 
 
1030 aa  505  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.07 
 
 
1030 aa  506  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.07 
 
 
1030 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.07 
 
 
1030 aa  506  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  30.98 
 
 
1030 aa  506  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.07 
 
 
1030 aa  505  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.98 
 
 
1030 aa  500  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.97 
 
 
1289 aa  496  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  31.63 
 
 
1023 aa  496  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  28.94 
 
 
1003 aa  496  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  30.58 
 
 
1017 aa  491  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  31.96 
 
 
1023 aa  491  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.23 
 
 
1030 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.96 
 
 
1329 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.14 
 
 
1018 aa  469  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  28.46 
 
 
1032 aa  465  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  32.04 
 
 
1009 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  28.45 
 
 
1030 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  31.81 
 
 
1012 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.31 
 
 
968 aa  436  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.83 
 
 
1003 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 
1020 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.68 
 
 
992 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.59 
 
 
1004 aa  392  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 
1017 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.06 
 
 
992 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  29.59 
 
 
1021 aa  379  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.44 
 
 
1424 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  36.2 
 
 
640 aa  364  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 
1022 aa  361  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  33.92 
 
 
628 aa  340  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.36 
 
 
996 aa  337  5.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.55 
 
 
1600 aa  295  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  40.17 
 
 
349 aa  236  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.43 
 
 
920 aa  184  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.2 
 
 
920 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  25.67 
 
 
951 aa  174  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  25.19 
 
 
972 aa  170  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 
987 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.79 
 
 
805 aa  155  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  31.32 
 
 
803 aa  154  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>